| 查看: 456 | 回复: 2 | |||
[交流]
【求助成功】急求linux中DMol3的inputfile脚本编写格式？
|
|
本人在win版MS中save file得到seedfile.input和seedfile.car两个文件，上传至服务器，然后用RunDMol3.sh运行seedfile，提示line contains an unrecognized keyword。本人将关键词的内容用括号替代，也提示错误，请高手指点！ # Task_parameters^M <-- Calculate(optimize)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: calculate(optimize)^M Opt_energy_convergence(1.0000e-005)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_energy_convergence(1.0000e-005)^M Opt_gradient_convergence(2.0000e-003^A)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_gradient_convergence(2.0000e-003^a)^M Opt_displacement_convergence(5.0000e-003^A)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_displacement_convergence(5.0000e-003^a)^M Opt_iterations(50)^M [ Last edited by lwg020810 on 2011-1-8 at 10:00 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有11人回复
-
表哥与省会女结婚，父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了
已经有7人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有8人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有7人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有10人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有9人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有10人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有6人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
-大龄未婚男找女朋友结婚
+1/242
-
华南师范大学（211）- 光电科学与工程学院 - 申请审核制（2026年4-5月份面试考核）
+2/114
-
威格焊接手套箱：稳定惰性环境，实现节能降本
+1/83
-
江西理工大学联合中国科学院赣江创新研究院招收2026级博士研究生
+1/83
-
香港科技大学（广州）黄加强课题组智能电池方向博士招聘
+1/80
-
坐标广州，征女友
+2/78
-
好玩的不敢搞，能搞的不挣钱，能挣钱的我不会做
+1/69
-
南方科技大学物理系夏秀杨课题组招收博士生/博士后 计算与理论软物质/生物物理方向
+1/30
-
香港中文大学（深圳）陈筱萌 课题组招生公告（博士 / 博后 / 硕士 / RA）
+1/15
-
澳门大学生物医学影像实验室诚招博士生（2026秋季入学）
+1/13
-
中南林业科技大学生物质绿色转化与功能材料课题组2026年博士招生
+1/12
-
队友
+1/7
-
化学行业，研发出创新的东西是做成项目给公司吃提成，还是自己搞小作坊倒卖？
+1/5
-
哈工大（深圳）物理招收2026年9月入学博士生1个名额
+1/4
-
哈工大 张乃庆课题组招收博士快响计划（名额充足），通过后随时入学
+1/4
-
美国密苏里大学“柔性电子”课题组诚招博士研究生
+1/3
-
上海理工顾敏院士/李蔚团队招收2026级博士研究生 （集成光学、量子信息方向）
+1/2
-
【经验分享】CRISPR基因敲除细胞系构建全流程踩坑指南——从递送方式选择到克隆筛选
+1/2
-
澳科大招收2026年秋季入学生物材料方向全奖博士研究生（3月5日截止）
+1/1
-
自荐：大模型ai辅助论文阅读软件：EasyReader论文易读
+1/1
2楼2011-01-07 15:10:10
★ ★ ★
sunyang1988(金币+3):谢谢总结 2011-01-08 12:35:29
sunyang1988(金币+3):谢谢总结 2011-01-08 12:35:29
|
本人惯用MS的server/computer client任务提交模式，而单独只在server上提交任务的standalone模式不是很了解，经多位虫友和qq群友的帮忙，现已解决。其实很简单 第一步，在win版MS中的得到.car和.input文件 第二步，将两文件上传至server，保证文件夹内有一个RunDMol3.sh即可 第三步，由于win版格式不能在linux系统正常读取，需转换.input文件格式，命令为dos2unix .input 回车即可 RunDMol3.sh seedfile就可以计算了 另一种转换input文件格式的方式是（没试过），在linux中vi .input，将内容复制粘贴应该也是可以的。 |
3楼2011-01-08 10:14:32