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greenking

木虫 (正式写手)


[交流] 【请教】质子化的水加氢

下面的问题折腾我很久了,看了不少文章也涉及这样的问题,但说的不详细,还是不知道该怎么处理~~~~

对于对称结构的分子(如P-1),分子中有不止一个结晶水分子,为了达到电荷平衡,需要将其中的一个水质子化,请问:
① 质子化一个水分子以后,由于分子是对称的,最终必定会产生两个质子化的水分  
    子。如果要指定某个需要质子化的水分子的占有率为50%,请问有根据说明是哪个
    水吗?
② 质子化的水在加氢时,怎么加呢?差值傅立叶加不出合适的氢来,理论加氢其角度也是固定死的,总是出现AB类错误~~~很着急!!
     

请高手们给与指点~~
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greenking

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by dpzhang at 2010-12-30 09:36:19:
如果真有个水分子被质子化了,从它的周围Q峰的分布是可以看出来的。如果是对称的,从grow后的形状也可以看出来的

从它的周围Q峰的分布看不出来的;从grow后的形状也看不出来,但是又是必须的,化合物不可能是带电的。很郁闷~~
5楼2010-12-30 10:53:27
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454106649

木虫 (著名写手)


~~

greenking(金币+2):谢谢你!! 2010-12-30 09:22:36
同问~
不过你试过每一个水分子了吗?
还有就是想让占有率为0.5,是不是可以作占有无序?~比如:(其中H1、H2和H3、H4坐标是一样的)
part 1
h1.......
h2.......
part 2
h3........
h4........
h5........
part 0
我不太懂,望批评指正!
2楼2010-12-30 08:06:04
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greenking

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by 454106649 at 2010-12-30 08:06:04:
同问~
不过你试过每一个水分子了吗?
还有就是想让占有率为0.5,是不是可以作占有无序?~比如:(其中H1、H2和H3、H4坐标是一样的)
part 1
h1.......
h2.......
part 2
h3........
h4........
h5...... ...

没有试过给氢作占有无序~~我不懂~~
3楼2010-12-30 09:24:11
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dpzhang

木虫 (正式写手)


如果真有个水分子被质子化了,从它的周围Q峰的分布是可以看出来的。如果是对称的,从grow后的形状也可以看出来的
4楼2010-12-30 09:36:19
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