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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】请问如何看vasp结构优化的过程，就像castep里面的轨迹一样。
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lightgjx

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问如何看vasp结构优化的过程，就像castep里面的轨迹一样。 已有4人参与

想看看vasp结构优化的优化过程是怎么样的，望高手指教，谢谢。
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1楼 2010-12-22 19:17:23
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhang668(金币+3):多谢指教！ 2010-12-23 18:44:45
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件，然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置的变化（动画显示)。
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blueybz
2楼2010-12-23 18:19:20
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lightgjx

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-12-23 18:19:20:
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件，然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置 ...

谢谢您的指教，受益匪浅。不过请问一下，如果想在window下看的话，应该用哪个软件呀，vesta可以吗

[ Last edited by lightgjx on 2010-12-24 at 09:09 ]
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3楼2010-12-24 08:38:25
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phys

木虫 (正式写手)
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JustPhysics
4楼2010-12-24 09:56:13
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-24 14:12:47
jmol可以在windows下面运行的。
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5楼2010-12-24 13:05:15
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lightgjx

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-12-24 13:05:15:
jmol可以在windows下面运行的。

十分谢谢！！！
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6楼2010-12-25 08:29:42
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blueybz

木虫 (正式写手)
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引用回帖:
1270174楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-12-23 18:19:20
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件，然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置的 ...

请问，可以把每个轨迹的坐标输出来吗？想分析一下具体的结构变化
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7楼2012-11-01 10:01:49
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
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sunyang1988: 金币+1, 专家考核, 谢谢热心帮助 2012-11-01 19:07:34
vtst里面也有其他的工具比较进行每一步离子上对于上一步的变化。

更多的分析，比如可能需要自己编个小程序进行数据处理。
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8楼2012-11-01 10:18:38
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