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lightgjx

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问如何看vasp结构优化的过程,就像castep里面的轨迹一样。 已有4人参与

想看看vasp结构优化的优化过程是怎么样的,望高手指教,谢谢。
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blueybz

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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引用回帖:
1270174楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-12-23 18:19:20
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件,然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置的 ...

请问,可以把每个轨迹的坐标输出来吗?想分析一下具体的结构变化
7楼2012-11-01 10:01:49
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zhang668(金币+3):多谢指教! 2010-12-23 18:44:45
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件,然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置的变化(动画显示)。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2010-12-23 18:19:20
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lightgjx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-12-23 18:19:20:
XDATCAR文件里面就收集了优化过程原中原子的位置。vtst里面带的一个perl脚本xdat2xyz.pl就可以将XDATCAR文件转换为movie.xyz文件,然后用可视化软件比如Molden、xcrysden或Jmol就可以打开它来看优化过程中原子位置 ...

谢谢您的指教,受益匪浅。不过请问一下,如果想在window下看的话,应该用哪个软件呀,vesta可以吗

[ Last edited by lightgjx on 2010-12-24 at 09:09 ]
3楼2010-12-24 08:38:25
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-24 14:12:47
jmol可以在windows下面运行的。
5楼2010-12-24 13:05:15
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