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nufang19a

金虫 (正式写手)


[交流] 【讨论】蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗?? 已有8人参与

蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗??还有更好的方法吗??我这个氨基酸序列有368个氨基酸,有一部分使用同源模建得到的结构很好,可有一部分全是loop区,这个很愁人,我想使用从头预测的方法试试,就搜索到了Rosetta。大家讨论一下,什么软件从头预测最好。谢谢各位了

[ Last edited by ghcacj on 2010-12-22 at 13:54 ]
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lsmmaomao

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-12-23 13:54:20:
前天刚听老师说了,从头预测的领头羊就是Rossetta。那个老师是分子模拟的牛人,我信奉他就如同信奉春哥~

您好!能不能告诉我您的老师是谁啊?我现在想做ab initio的模拟,是100个Aa的蛋白质片段~~或者你能不能告诉我一下关于rosetta的情况?要怎么提交任务?如果自己在机子上运行 需要什么硬件支持?谢谢!!之分期待您的答复!!
12楼2011-07-11 10:22:06
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普通回帖

nufang19a

金虫 (正式写手)


自己顶,别落下去了。期待大家的讨论与回复
2楼2010-12-22 13:44:19
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nufang19a

金虫 (正式写手)


3楼2010-12-22 13:46:55
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nufang19a

金虫 (正式写手)


自己再顶,一直顶上去
4楼2010-12-22 14:45:35
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nufang19a

金虫 (正式写手)


顶,顶,期待大家的发言
5楼2010-12-22 16:27:26
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wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:48:39
看过几篇rosetta做的文章,确实认可度比较高
6楼2010-12-22 20:09:04
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gzgzgz

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-23 15:48:48
最猛的是Zhang, Yang的服务器吧,连续几年都在CASP夺冠,现在从U of Kansas搬到U of Michigan了。
7楼2010-12-23 05:34:35
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也去看看那个Rosetta呀
8楼2010-12-23 06:28:38
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petersen

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:48:59
引用回帖:
Originally posted by nufang19a at 2010-12-22 13:43:49:
蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗??还有更好的方法吗??我这个氨基酸序列有368个氨基酸,有一部分使用同源模建得到的结构很好,可有一部分全是loop区,这个很愁人,我想使用从头预测的方法试试,就搜索到了 ...

前天刚听老师说了,从头预测的领头羊就是Rossetta。那个老师是分子模拟的牛人,我信奉他就如同信奉春哥~
9楼2010-12-23 13:54:20
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nufang19a

金虫 (正式写手)


已经下载,晚上安装
10楼2010-12-23 14:54:02
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