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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗？？
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nufang19a

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗？？ 已有8人参与

蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗？？还有更好的方法吗？？我这个氨基酸序列有368个氨基酸，有一部分使用同源模建得到的结构很好，可有一部分全是loop区，这个很愁人，我想使用从头预测的方法试试，就搜索到了Rosetta。大家讨论一下，什么软件从头预测最好。谢谢各位了

[ Last edited by ghcacj on 2010-12-22 at 13:54 ]
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1楼 2010-12-22 13:43:49
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lsmmaomao

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-12-23 13:54:20:
前天刚听老师说了，从头预测的领头羊就是Rossetta。那个老师是分子模拟的牛人，我信奉他就如同信奉春哥～

您好！能不能告诉我您的老师是谁啊？我现在想做ab initio的模拟，是100个Aa的蛋白质片段~~或者你能不能告诉我一下关于rosetta的情况？要怎么提交任务？如果自己在机子上运行 需要什么硬件支持？谢谢！！之分期待您的答复！！
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12楼2011-07-11 10:22:06
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普通回帖

nufang19a

金虫 (正式写手)
自己顶，别落下去了。期待大家的讨论与回复
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2楼2010-12-22 13:44:19
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nufang19a

金虫 (正式写手)
再顶
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3楼2010-12-22 13:46:55
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nufang19a

金虫 (正式写手)
自己再顶，一直顶上去
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4楼2010-12-22 14:45:35
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nufang19a

金虫 (正式写手)
顶，顶，期待大家的发言
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5楼2010-12-22 16:27:26
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wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:48:39
看过几篇rosetta做的文章，确实认可度比较高
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6楼2010-12-22 20:09:04
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gzgzgz

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-23 15:48:48
最猛的是Zhang, Yang的服务器吧，连续几年都在CASP夺冠，现在从U of Kansas搬到U of Michigan了。
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7楼2010-12-23 05:34:35
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也去看看那个Rosetta呀
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8楼2010-12-23 06:28:38
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petersen

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-23 15:48:59
引用回帖:
Originally posted by nufang19a at 2010-12-22 13:43:49:
蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗？？还有更好的方法吗？？我这个氨基酸序列有368个氨基酸，有一部分使用同源模建得到的结构很好，可有一部分全是loop区，这个很愁人，我想使用从头预测的方法试试，就搜索到了 ...

前天刚听老师说了，从头预测的领头羊就是Rossetta。那个老师是分子模拟的牛人，我信奉他就如同信奉春哥～
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9楼2010-12-23 13:54:20
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nufang19a

金虫 (正式写手)
已经下载，晚上安装
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10楼2010-12-23 14:54:02
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