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【求助】A类错误
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各路高手帮我看看这个A类错误是怎么回事。 --------------------------------------------------------------------------------Alert level A PLAT725_ALERT_2_A D-H Calc 0.84000, Rep 4.56500 Dev... 3.73 Ang. O4 -H4B1 1.555 1.555 # 20 PLAT482_ALERT_4_A Small D-H..A Angle Rep for O4 .. O2 .. 2.74 Deg. PLAT776_ALERT_1_A Suspect D-H Dist in CIF: O4 -- H4B1 .. 4.57 Ang. -------------------------------------------------------------------------------- 我在检测时候本来都没有错误了，但是在写CIF文件时候在最后氢键数据上 写了yes 就出现了好多错误 |
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我在CIF 中 loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A O4 H4B1 O2 0.84 1.98 2.736(5) 150.1 4_565 O4 H4B1 Br1 0.84 3.12 3.739(4) 132.7 4_565 O4 H4B2 Br1 0.89 2.51 3.378(4) 166.7 2_655 后面的氢键加上yes 就没法check cif 显示 Syntax problems Your CIF has syntax errors as listed below. No further checks will be performed. Please fix and recheck your CIF. -------------------------------------------------------------------------------- ERROR: Number of loop elements not multiple of packetsize at line 568 >>> "p!?" *** A loop_ header defines a list of datanames. The values following this header are assigned in sequence with the datanames in the header, so each packet of information (or row in the table of values defined by the loop structure) must have the same number of values as there are datanames declared in the loop header. Common reasons for this error include: omission of a value where the associated data are absent (insert . or ? as placeholders); numeric values where the standard uncertainty (or e.s.d) has come adrift from its associated value (e.g. 10.925 (2)); multi-word phrases or text entries that are not properly delimited with quote marks or initial semicolons. ! NOTE: the problem may lie in the loop prior to the indicated line number. 怎么办啊？ |
2楼2010-12-22 15:28:06
3楼2010-12-22 16:44:55
4楼2010-12-22 17:31:40
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倚门回首(金币+5): 2010-12-22 19:31:35
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流 2010-12-22 19:51:55
倚门回首(金币+5): 2010-12-22 19:31:35
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流 2010-12-22 19:51:55
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你实在想加yes的话，得有yes这一列的相应解释，也就是在 loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A 的下面再添加一行：_geom_hbond_publ_flag 添加这一行后再在氢键后面加yes就可以了，试一下。 |
5楼2010-12-22 18:55:11
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我加上那个语句就无法check cif Your CIF has syntax errors as listed below. No further checks will be performed. Please fix and recheck your CIF. -------------------------------------------------------------------------------- ERROR: Number of loop elements not multiple of packetsize at line 332 >>> "_diffrn_measured_fraction_theta_max"  |
6楼2010-12-22 19:22:45
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刚刚我改了一下格式，但是仍然出现了，非常多的A类错误。 --------------------------------------------------------------------------------Alert level A PLAT726_ALERT_2_A H...A Calc 6.99000, Rep 3.12000 Dev... 3.87 Ang. H4B1 -BR1 1.555 4.565 # 20 PLAT726_ALERT_2_A H...A Calc 8.83000, Rep 2.51000 Dev... 6.32 Ang. H4B2 -BR1 1.555 2.655 # 20 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 6.350(4), Rep 3.739(4), Dev.. 652.75 Sigma O4 -BR1 1.555 4.565 # 20 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 8.887(4), Rep 3.378(4), Dev.. 1377.25 Sigma O4 -BR1 1.555 2.655 # 20 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 39.00, Rep 132.70 Dev... 93.70 Deg. O4 -H4B1 -BR1 1.555 1.555 4.565 # 32 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 91.00, Rep 166.70 Dev... 75.70 Deg. O4 -H4B2 -BR1 1.555 1.555 2.655 # 32 这可怎么办啊 |
7楼2010-12-22 19:29:54
8楼2010-12-22 19:35:32
9楼2010-12-23 09:46:25
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呵呵。。。只是在CIF 文件中使之生成氢键表 loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag O4 H4B1 O2 0.84 1.98 2.736(5) 150.1 4_565 yes O4 H4B1 Br1 0.84 3.12 3.739(4) 132.7 4_565 yes O4 H4B2 Br1 0.89 2.51 3.378(4) 166.7 2_655 yes |
10楼2010-12-23 09:50:08
11楼2010-12-23 10:01:49