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紫鱼天堂

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用Dmol3优化羟自由基输出文件中找somo 已有3人参与

RT.
近期用dmol3优化了羟自由基得到的部分输出文件如下:

Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.25437Ha    -6.922eV
  HOMO is orbital number     9
  LUMO is orbital number    10

    state                         eigenvalue        occupation
                              (au)          (ev)

    1   +   1   a        -18.839821      -512.658     1.000
    2   -   1   a        -18.815997      -512.010     1.000
    3   +   2   a         -0.911999       -24.817     1.000
    4   -   2   a         -0.857755       -23.341     1.000
    5   +   3   a         -0.413550       -11.253     1.000
    6   -   3   a         -0.391548       -10.655     1.000
   7   +   4   a         -0.346673        -9.433     1.000
    8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000
    9   -   4   a         -0.254372        -6.922     1.000
   10   -   5   a         -0.226063        -6.151     0.000
   
11   +   6   a          0.037095         1.009     0.000
   12   -   6   a          0.045284         1.232     0.000


  Orbital occupation is:
    5  a  ( 1) alpha and   4  a  ( 1) beta
  Total number electrons:               9.0

从上面分析来看,羟自由基有9个电子,占据了前五个轨道,其中第五个轨道上有1个电子,那么羟自由基的SOMO轨道应该是第五个轨道吧
但是,如上面斜体,从各个轨道的特征值来看,第8行-5轨道的能值比第9行-4轨道的能值还要低,这样的话确定第五个轨道为SOMO对吗?

注:我使用的泛函是GGA/BLYP,基组选择的是DNP.
还请各位高手多多指点,感激不尽。。。

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-12-21 at 19:21 ]
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ykwang

金虫 (正式写手)


ellsaking(金币+1):感谢回帖交流~ 2010-12-21 19:24:55
引用回帖:
Originally posted by 紫鱼天堂 at 2010-12-21 18:19:15:
哦,这样的话就是说不用考虑他的特征值量大小了是吗?
多谢多谢

按照定义应该是这样。
Nothing_Is_Impossible!
4楼2010-12-21 18:31:46
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查看全部 8 个回答

ykwang

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ellsaking(金币+1):谢谢解答~ 2010-12-21 19:24:41
根据SOMO的定义应该是:
8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000
Nothing_Is_Impossible!
2楼2010-12-21 17:20:24
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紫鱼天堂

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-21 17:20:24:
根据SOMO的定义应该是:
8   +   5   a         -0.277333        -7.547     1.000

哦,这样的话就是说不用考虑他的特征值量大小了是吗?
多谢多谢
3楼2010-12-21 18:19:15
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紫鱼天堂

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-12-21 18:31:46:


按照定义应该是这样。

额,还想请教一个问题。就还比如羟自由基吧,如果比较羟自由基容不容易进攻其他非自由基基团时,是不是拿羟自由基的SOMO与非自由基基团的HOMO或者LUMO相比较就可以了?与HOMO最接近的话就易得到电子,与LUMO接近的话就易失去电子?
5楼2010-12-21 18:51:55
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