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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】差分电荷密度
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】差分电荷密度

请问大家，掺杂体系的差分电荷密度怎么算呢？看以前的帖子说，差分电荷密度有两种算法，一种是自洽减非自洽的，一种是用AB-A-B的算法，A B 是其中的元素，我如果用第二种方法的话，应该怎么考虑掺杂原子呢？
谢谢大家
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228

[ Last edited by xiaojie7783 on 2010-12-19 at 09:28 ]
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1楼 2010-12-19 09:22:54
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stractor

金虫 (著名写手)
★ ★
zhang668(金币+2):多谢交流 2010-12-21 11:15:35
引用回帖:
Originally posted by xiaojie7783 at 2010-12-21 09:07:49:

你的意思是说，在计算A B 的时候，要设置ICHARGE=12是吗？然后NGXF...也要和计算掺杂体系时选取的一致是吗？期待您的解答

原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了。差分电荷迷途就是说明这个差别的。
假设一个晶胞中有两种原子A和B，差分电荷密度就是所计算的晶胞自洽的电荷密度减去晶胞里面各原子电荷密度。而原子电荷密度就设置ICHARG=12,它的意思是不进行自洽过程，直接把各原子周围的电荷密度叠加起来（这就相当于孤立原子的电荷的叠加）。NGFX这些要设置一致就是要求电荷密度存储的矩阵大小一致，这样才能用矩阵加减求得差分电荷密度。

只能说到这个程度了。
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8楼2010-12-21 11:12:56
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普通回帖

4010808

木虫 (小有名气)
★ ★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
zhang668(金币+1):多谢交流 2010-12-20 18:12:26
引用回帖:
Originally posted by xiaojie7783 at 2010-12-19 09:22:54:
请问大家，掺杂体系的差分电荷密度怎么算呢？看以前的帖子说，差分电荷密度有两种算法，一种是自洽减非自洽的，一种是用AB-A-B的算法，A B 是其中的元素，我如果用第二种方法的话，应该怎么考虑掺杂原子呢？
谢谢 ...

如果是掺杂 你做差分想得到什么信息呢
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2楼2010-12-20 16:23:49
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stractor

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
zhang668(金币+2):多谢指教 2010-12-20 18:12:35
你提到的这两种方法是一样的吧。非自洽就是原子电荷密度的叠加，就是你所说的A.B的原子电荷分布，设置ICHARGE=12就可得到原子电荷密度。此外要注意保存电荷密度的网格要一致，这样才便于作图时数组的加减，设置NGFX,NGFY和NGFZ的值。
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3楼2010-12-20 17:10:28
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 4010808 at 2010-12-20 16:23:49:



如果是掺杂 你做差分想得到什么信息呢

我也不清楚，能看成键吗？
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4楼2010-12-20 17:33:41
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-12-20 17:10:28:
你提到的这两种方法是一样的吧。非自洽就是原子电荷密度的叠加，就是你所说的A.B的原子电荷分布，设置ICHARGE=12就可得到原子电荷密度。此外要注意保存电荷密度的网格要一致，这样才便于作图时数组的加减，设置NG ...

你的意思是说，在计算A B 的时候，要设置ICHARGE=12是吗？然后NGXF...也要和计算掺杂体系时选取的一致是吗？期待您的解答
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7楼2010-12-21 09:07:49
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4010808

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-12-21 11:12:56:


原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了 ...

您好，请问这里您提到的是A,B两个原子的情况，若A和B都不是原子而是几个原子构成的分子，那么对于单独的A和B，再用非自洽就有问题了吧，因为单独的A或B的电荷分布都不是内部原子的电荷简单的叠加了。请问这里是不是要换成自洽了？谢谢
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9楼2010-12-22 23:35:34
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redskywei

木虫 (著名写手)
★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
这个差分电荷密度是否可以理解为AB组成体系后电荷密度的值，减去A和B各自单独情况下的电荷密度值的和，所最后得到的电荷密度分布？
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10楼2010-12-22 23:51:39
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-23 00:12:43
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-12-21 11:12:56:


原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了 ...

设置ICHARGE=12计算电荷密度是用驰豫好的结构非自洽计算吧
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11楼2010-12-22 23:51:45
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redskywei

木虫 (著名写手)
还有，差分密度的英文说法是deformation charge density 还是difference charge density ?
顺便请教一下。呵呵。
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12楼2010-12-22 23:52:58
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suanzao9999

金虫 (初入文坛)
★ ★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):鼓励交流 2010-12-23 16:21:32
引用回帖:
Originally posted by redskywei at 2010-12-22 23:52:58:
还有，差分密度的英文说法是deformation charge density 还是difference charge density ?
顺便请教一下。呵呵。

差分密度的英文说法是deformation charge density ,difference charge density 是二次差分图
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13楼2010-12-23 08:46:35
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jugengfans

金虫 (正式写手)
★ ★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-11 10:56:21
看杂质与体系新形成的键用自洽的 AB-(A+B)
第一种给出的是晶体中所有原子的键。
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14楼2011-01-23 23:51:59
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haowenping

木虫 (著名写手)
★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-12-21 11:12:56:
原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了 ...

专家你好，我想问下你，我在计算静态的时候只设置了NGX参数，并没有设置NGFX参数，像你说的那样，我是不是只需要把静态计算里的INCAR，KPOINTS,POSCAR,POTCAR拷贝到另一个文件夹下面。然后在设置INCAR，把ICHARG=2改成12吗？可是我在计算静态的时候并没设置ＮＧＦＸ，那么我在进行这次非静态自洽的时候也不设置ＮＧＦＸ行吗？期待你的回答，谢谢！
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15楼2011-04-11 09:13:07
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stractor

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-13 08:47:45
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2010-12-22 23:51:45:
设置ICHARGE=12计算电荷密度是用驰豫好的结构非自洽计算吧

是的，两种计算情况下原子占据晶格的位置要一样。
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16楼2011-04-13 00:48:39
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jwucn

至尊木虫 (文坛精英)
★
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
8楼: Originally posted by stractor at 2010-12-21 11:12:56:
原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了 ...

差分密度用CASTEP来计算时,有所谓的ICHARGE=12这个选项吗?没有的话,如何实现这个功能呢?
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17楼2011-12-23 15:51:49
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guodonglin

至尊木虫 (职业作家)
★
xiaojie7783(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1890615楼: Originally posted by stractor at 2011-04-13 00:48:39:
是的，两种计算情况下原子占据晶格的位置要一样。

计算差分电荷密度时，先弛豫在做自洽计算，得到 CHGCAR。 做非自洽计算时，我有问题请教你：
  （1）非自洽计算，结构用弛豫后的结构，还是没有经过弛豫的结构
  （2）非自洽计算，INCAR中需要设置 ICHARG=12 ，但是是否需要设置 NELM=0，谢谢
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18楼2012-03-23 11:05:18
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Gina88

木虫 (正式写手)
★
xiaojie7783(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1176149楼: Originally posted by stractor at 2010-12-21 11:12:56
原子相互靠近，电子发生相互作用，那么原来各原子周围的电荷分布就会发生变化，可以这么说，自洽的过程就是寻找这个合理的电荷分布过程。那么自洽后的电荷密度分布就和原子之间没发生相互作用的电荷分布不同了。 ...

我也想知道计算差分电荷密度时：
1）差分前后电荷密度网格一致。
2）差分前后晶胞大小一致。
3）原子在差分前后的位置一致。
请问：计算差分电荷时，对2），3）有没有要求？
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20楼2012-07-28 13:58:50
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简单回复
chdh8806185楼
2010-12-20 18:09   回复  
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
ellsaking:求助贴中请不要发纯水帖~ 2010-12-20 20:35:17
LL8688906楼
2010-12-20 18:40   回复  
xiaojie7783(金币+1):谢谢参与
ellsaking:求助帖中请不要发纯水帖~ 2010-12-20 20:35:43
wangjb40119楼
2012-07-13 10:40   回复  
xiaojie7783(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1083785楼: Originally posted by xiaojie7783 at 2010-12-19 09:22:54 请问大家，掺杂体系的差分电荷密度怎么算呢？看以前的帖子说，差分电荷密度有两种算法，一种是自洽减非自洽的，一种是用AB-A-B的算法，A B 是其中的元素，我如果用第二种方法的话，应该怎么考虑掺杂原子呢？ 谢谢大 ...

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