24小时热门版块排行榜    

查看: 1551  |  回复: 12
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 minmin_0082003 的 6 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪,Au10 簇 被优化成了4组小簇,为什么,输入及结构已贴出

用的网上贴出来的pesudopotential
输入文件如下
&CONTROL
  calculation    = "relax",
  prefix         = "iso0-Au10-t"
  nstep          = 150,
  pseudo_dir   = "/home/***/PWscf/Pseudo",
  outdir       = "/home/***/PWscf/outdir",
/
&SYSTEM
  nosym       = .TRUE.,
  ibrav       = 0,
  celldm(1)   = 1.0D0,
  nat         = 10,
  ntyp        = 1,
  ecutwfc     = 25.0D0,
  ecutrho     = 160.0D0,
  occupations = "smearing",
  degauss     = 0.01D0,
  smearing    = "gauss",
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.5D0,
/
&IONS
  bfgs_ndim         = 3,
  upscale           = 100.D0,
  pot_extrapolation = "second_order",
  wfc_extrapolation = "second_order",
/
ATOMIC_SPECIES
Au  196.96655  Au.blyp-mt.UPF
ATOMIC_POSITIONS { angstrom }
Au  0.351644000      0.323076000      0.020090000
Au  0.353167000     -2.459480000      0.001629000
Au  0.325466000     -5.209497000      0.021409000
Au -1.052830000     -1.054437000      1.988954000
Au -1.026740000      1.696543000      1.965435000
Au -1.051203000     -3.836601000      1.970273000
Au  1.727775000     -1.054277000     -1.924117000
Au  1.723939000     -3.829706000     -1.938591000
Au -2.418980000      0.317707000      3.931133000
Au -2.429430000     -2.457304000      3.913504000
K_POINTS {Gamma}
CELL_PARAMETERS { cubic }
  15.00000  0.00000  0.00000
   0.00000  15.00000  0.00000
   0.00000  0.00000  15.00000

输入文件是从高斯优化得到的

输出文件时PWscf得到的
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yoghurt117

木虫 (正式写手)


★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢分享 2010-12-21 08:16:55
minmin_0082003(金币+1):谢谢,Au10 有很多的异构体,我算的是最稳定的一个 2010-12-21 09:31:22
曾经从网上找了个Au10的结构,跟你的好像不一样
Au    -.79776090   -.69523418   2.61154030
Au     .21885458   1.44933212   1.53546771
Au    1.72079748   -.80162079   1.64308518
Au   -2.27547260    .67789930    .81619191
Au    -.38520612  -1.04247831   -.00370155
Au    1.88256086    .84182724   -.50326931
Au    -.60370245   1.76230683  -1.01776187
Au    2.04405802  -1.73293814   -.87099203
Au   -2.20281778   -.16059519  -1.74977567
Au     .39868891   -.29849888  -2.46078469
可以算算看看
4楼2010-12-21 00:07:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

hakuna

木虫 (知名作家)


★ ★
zzy870720z(金币+2):鼓励交流 2010-12-19 11:41:23
minmin_0082003(金币+3):谢谢,原因已经解决,是因为pseudopotential的问题,但是为什么configure 不同得到结果不同还不清楚 2010-12-19 14:04:01
个人感觉初始结构不合理,你把六边形外面的两个Au放在六边形里两个相对空隙上面试试看,如果一定要优化出一个平面结构,建议把左侧Au原子位置下移,使之与左下侧连个Au原子形成三角形结构,这样对称性高一些.....
2楼2010-12-19 10:26:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ellsaking(金币+1):写一写出了什么问题也让大家借鉴一下吧,哈哈~ 2010-12-22 09:57:08
原因已经找到, 问题初步解决
3楼2010-12-19 14:04:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yoghurt117

木虫 (正式写手)



zzy870720z(金币+1):鼓励交流 2010-12-22 07:57:44
10至56个金Au的团簇结构请到下面的网址下载
http://u.115.com/file/f4e82e1827

这些结构也是我当初从网上找的,rar里面有网页介绍
5楼2010-12-22 00:36:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 为什么小修又是送审 +4 woshichuxuan 2024-11-16 5/250 2024-11-16 20:38 by woshichuxuan
[考博] 随缘读博 一篇中科院一区Top 一篇中科院二区Top 两篇专利 +7 Ricoch4t 2024-11-13 16/800 2024-11-16 18:49 by 千重稻菽浪
[有机交流] 二甲胺的使用 20+5 太阳谷 2024-11-14 15/750 2024-11-16 18:14 by hweupa
[论文投稿] 期刊选择 +3 上善若水 cc 2024-11-15 4/200 2024-11-16 17:21 by BladeShen
[基金申请] 变性人申请基金咋算性别? +22 leicahfs 2024-11-11 22/1100 2024-11-16 15:31 by 竹子宝
[考博] 联系的博导说有时间聊一聊 我回复了自己可以的时间后 博导就没再回复 +7 evan0489 2024-11-15 7/350 2024-11-16 15:16 by zyqchem
[精细化工] 同一个反应相同的反应条件,是不是反应结果相差不大? +6 青霉素 2024-11-11 6/300 2024-11-16 13:35 by linjunc
[第一性原理] 有没有要一起买VASP版权的,可以6个人 5+3 变成小神 2024-11-14 9/450 2024-11-16 13:33 by dxcharlary
[论文投稿] 论文返修状态变成了awaiting AE recommendation 10+4 猪小耍 2024-11-13 15/750 2024-11-16 09:24 by guxue
[教师之家] 北大教授何怀宏曾如此描述他的同行 +13 zju2000 2024-11-09 13/650 2024-11-16 07:45 by 080520dxf
[教师之家] 这种人痛苦吗 +12 2671 2024-11-12 14/700 2024-11-15 22:15 by 仇恨毁灭财富
[教师之家] 大学老师 +11 考研一路顺风 2024-11-13 14/700 2024-11-15 15:24 by LNP@mRNA
[基金申请] 去年七月底入站的还能申请下一批吗? +4 brightwo 2024-11-14 4/200 2024-11-15 14:18 by gazi1111
[基金申请] 博后基金分组排名 +7 攻城2025 2024-11-14 7/350 2024-11-14 21:19 by 实验小白ha
[硕博家园] 研究生的生活该是什么样 +4 lqy0719 2024-11-14 4/200 2024-11-14 16:45 by 阿荣喝酒
[硕博家园] 大龄已婚想读博如何 +15 米娅阳 2024-11-11 18/900 2024-11-14 14:18 by xiaomi0401
[基金申请] 76批博后基金 +3 feiyi3986 2024-11-14 3/150 2024-11-14 11:50 by puly
[基金申请] 博后面上出结果了 +5 wl87925139 2024-11-14 5/250 2024-11-14 10:26 by kingmax18996
[论文投稿] 求JACS和ACIE的最新文章模板 10+4 Jane060390 2024-11-10 4/200 2024-11-13 09:13 by 北京莱茵润色
[硕博家园] 如何看清华北大硕博的毕业论文 +6 2025lucky 2024-11-10 6/300 2024-11-12 22:46 by 楚扬长流
信息提示
请填处理意见