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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇 被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇 被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出

用的网上贴出来的pesudopotential
输入文件如下
&CONTROL
  calculation    = "relax",
  prefix         = "iso0-Au10-t"
  nstep          = 150,
  pseudo_dir   = "/home/***/PWscf/Pseudo",
  outdir       = "/home/***/PWscf/outdir",
/
&SYSTEM
  nosym       = .TRUE.,
  ibrav       = 0,
  celldm(1)   = 1.0D0,
  nat         = 10,
  ntyp        = 1,
  ecutwfc     = 25.0D0,
  ecutrho     = 160.0D0,
  occupations = "smearing",
  degauss     = 0.01D0,
  smearing    = "gauss",
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.5D0,
/
&IONS
  bfgs_ndim         = 3,
  upscale           = 100.D0,
  pot_extrapolation = "second_order",
  wfc_extrapolation = "second_order",
/
ATOMIC_SPECIES
Au  196.96655  Au.blyp-mt.UPF
ATOMIC_POSITIONS { angstrom }
Au  0.351644000      0.323076000      0.020090000
Au  0.353167000     -2.459480000      0.001629000
Au  0.325466000     -5.209497000      0.021409000
Au -1.052830000     -1.054437000      1.988954000
Au -1.026740000      1.696543000      1.965435000
Au -1.051203000     -3.836601000      1.970273000
Au  1.727775000     -1.054277000     -1.924117000
Au  1.723939000     -3.829706000     -1.938591000
Au -2.418980000      0.317707000      3.931133000
Au -2.429430000     -2.457304000      3.913504000
K_POINTS {Gamma}
CELL_PARAMETERS { cubic }
  15.00000  0.00000  0.00000
   0.00000  15.00000  0.00000
   0.00000  0.00000  15.00000

输入文件是从高斯优化得到的

输出文件时PWscf得到的
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1楼2010-12-17 11:39:54
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hakuna

木虫 (知名作家)
★ ★
zzy870720z(金币+2):鼓励交流 2010-12-19 11:41:23
minmin_0082003(金币+3):谢谢，原因已经解决，是因为pseudopotential的问题，但是为什么configure 不同得到结果不同还不清楚 2010-12-19 14:04:01
个人感觉初始结构不合理，你把六边形外面的两个Au放在六边形里两个相对空隙上面试试看，如果一定要优化出一个平面结构，建议把左侧Au原子位置下移，使之与左下侧连个Au原子形成三角形结构，这样对称性高一些.....
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2楼2010-12-19 10:26:47
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hakuna

木虫 (知名作家)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论交流 2010-12-23 16:22:37
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-12-22 14:22:30:
觉得参考价值不大，20左右金原子数的Aun团簇应该是中空结构才对，较新的DFT计算和一些实验也证实了这点的。。。


金球是可能存在的，但不应该是最稳定结构，最稳定结构应该是成键最多的结构，显然没心没肺的金球不是成键最多的....
C球能稳定赖于共价键，但它稳定性上恐怕还是赶不上金刚钻.....
声明一下：没有计算过，所以只是一个判断
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11楼2010-12-23 09:41:09
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hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-12-23 09:50:38:
呵呵，对与Au团簇，如果没算过，是不能轻易下判断的，我看到一片文献好像是Au20，是金字塔形状，但中间是中空的。根据我自己的经验，以前对Au13作了检验，用模拟退火方法找出来的结构已经有呈中空状态的趋势了，原 ...

总感觉那样与常识相悖，能给出个令人信服的理由吗？
虽然空的金字塔里流荡着法老的幽灵，但那真的是最稳定结构吗？亦或是作者弄出来的玄虚？
不知道你用什么势函数退的火？SA理论上可以找到能量最低点，只是理论而已，相比之下，GA可能更好一些

[ Last edited by hakuna on 2010-12-23 at 19:41 ]
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13楼2010-12-23 19:32:52
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