版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药等3个专业接受调剂

返回列表

【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 minmin_0082003 的 6 个金币

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

minmin_0082003

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出

用的网上贴出来的pesudopotential
输入文件如下
&CONTROL
  calculation = "relax",
  prefix       = "iso0-Au10-t"
  nstep       = 150,
  pseudo_dir = "/home/***/PWscf/Pseudo",
  outdir    = "/home/***/PWscf/outdir",
/
&SYSTEM
  nosym    = .TRUE.,
  ibrav    = 0,
  celldm(1) = 1.0D0,
  nat       = 10,
  ntyp       = 1,
  ecutwfc    = 25.0D0,
  ecutrho    = 160.0D0,
  occupations = "smearing",
  degauss    = 0.01D0,
  smearing = "gauss",
/
&ELECTRONS
  conv_thr = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.5D0,
/
&IONS
  bfgs_ndim       = 3,
  upscale          = 100.D0,
  pot_extrapolation = "second_order",
  wfc_extrapolation = "second_order",
/
ATOMIC_SPECIES
Au  196.96655  Au.blyp-mt.UPF
ATOMIC_POSITIONS { angstrom }
Au  0.351644000    0.323076000    0.020090000
Au  0.353167000    -2.459480000    0.001629000
Au  0.325466000    -5.209497000    0.021409000
Au -1.052830000    -1.054437000    1.988954000
Au -1.026740000    1.696543000    1.965435000
Au -1.051203000    -3.836601000    1.970273000
Au  1.727775000    -1.054277000    -1.924117000
Au  1.723939000    -3.829706000    -1.938591000
Au -2.418980000    0.317707000    3.931133000
Au -2.429430000    -2.457304000    3.913504000
K_POINTS {Gamma}
CELL_PARAMETERS { cubic }
  15.00000  0.00000  0.00000
0.00000  15.00000  0.00000
0.00000  0.00000  15.00000

输入文件是从高斯优化得到的

输出文件时PWscf得到的

回复此楼

» 猜你喜欢

材料专硕331求调剂已经有9人回复
面上项目一般是几位通讯评审专家？已经有12人回复
求化学调剂已经有5人回复
一志愿东北大学材料工程已经有4人回复
0805 301分请求调剂已经有7人回复
0805一志愿南信大301分请求调剂已经有4人回复
一志愿东北大学专硕308分材料工程085601求调剂已经有3人回复
材料调剂已经有11人回复
化学322求调剂已经有4人回复
304求调剂已经有4人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

优化聚合物结构时，是摆成环形还是应该摆成直线形已经有5人回复
ubuntu下载下来提示安装后什么都没安装就可以启动，感觉奇怪啊。。。已经有21人回复
用w2web界面计算性质之前的结构优化已经有7人回复
求助解决活性炭浓硫酸改性发生的奇怪现象已经有12人回复
正交优化实验是怎么设计的啊？已经有16人回复
B2被要求补交research plan，好奇怪，求交流！已经有13人回复
castep固定体积的结构优化和计算声子谱的问题已经有25人回复
求助链霉菌培养及优化已经有5人回复
CASTEP对优化后的晶体进行分态密度分析，应该怎么操作已经有14人回复
【关注SCI期刊点评】系统优化意见征集中~~~~~~~~~~ 已经有220人回复
【求助】MS4.4 优化失败，但是此结构放在MS2.2却能优化成功已经有14人回复
【求助】优化团簇频率小说明什么已经有5人回复
【求助】求解：geom=connectivity对过渡金属簇合物优化结果有什么影响已经有8人回复
【求助】dmol3优化计算团簇的温度应该是多少已经有4人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:
查看全部散金贴

1楼2010-12-17 11:39:54

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

1ST强帖: 3
应助: 82 (初中生)
金币: 8857.9
帖子: 5598
在线: 1366.7小时
虫号: 167622

★ ★
zzy870720z(金币+2):鼓励交流 2010-12-19 11:41:23
minmin_0082003(金币+3):谢谢，原因已经解决，是因为pseudopotential的问题，但是为什么configure 不同得到结果不同还不清楚 2010-12-19 14:04:01

个人感觉初始结构不合理，你把六边形外面的两个Au放在六边形里两个相对空隙上面试试看，如果一定要优化出一个平面结构，建议把左侧Au原子位置下移，使之与左下侧连个Au原子形成三角形结构，这样对称性高一些.....

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2010-12-19 10:26:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

1ST强帖: 3
应助: 82 (初中生)
金币: 8857.9
帖子: 5598
在线: 1366.7小时
虫号: 167622

★
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论交流 2010-12-23 16:22:37

引用回帖:

Originally posted by hchfox at 2010-12-22 14:22:30:
觉得参考价值不大，20左右金原子数的Aun团簇应该是中空结构才对，较新的DFT计算和一些实验也证实了这点的。。。

金球是可能存在的，但不应该是最稳定结构，最稳定结构应该是成键最多的结构，显然没心没肺的金球不是成键最多的....
C球能稳定赖于共价键，但它稳定性上恐怕还是赶不上金刚钻.....
声明一下：没有计算过，所以只是一个判断

赞一下(1人)

回复此楼

11楼2010-12-23 09:41:09

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

1ST强帖: 3
应助: 82 (初中生)
金币: 8857.9
帖子: 5598
在线: 1366.7小时
虫号: 167622

引用回帖:

Originally posted by hchfox at 2010-12-23 09:50:38:
呵呵，对与Au团簇，如果没算过，是不能轻易下判断的，我看到一片文献好像是Au20，是金字塔形状，但中间是中空的。根据我自己的经验，以前对Au13作了检验，用模拟退火方法找出来的结构已经有呈中空状态的趋势了，原 ...

总感觉那样与常识相悖，能给出个令人信服的理由吗？
虽然空的金字塔里流荡着法老的幽灵，但那真的是最稳定结构吗？亦或是作者弄出来的玄虚？
不知道你用什么势函数退的火？SA理论上可以找到能量最低点，只是理论而已，相比之下，GA可能更好一些

[ Last edited by hakuna on 2010-12-23 at 19:41 ]

赞一下

回复此楼

13楼2010-12-23 19:32:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 minmin_0082003 的主题更新

返回列表

最具人气热帖推荐 [查看全部]		作者	回/看	最后发表

[考研] 材料科学与工程290学硕求调剂 +5	双马尾痞老板2 2025-04-04	5/250	2025-04-05 22:30 by nanaliuyun
[考研] 材料 085600 求调剂 +15	jiangaook 2025-04-03	16/800	2025-04-05 22:26 by 子訡千羽
[考研] 085600一志愿中科大总分331 +14	yqs0508 2025-03-31	28/1400	2025-04-05 16:31 by 手札礼记
[考研] 344求调剂材料工程，一志愿西北工业大学 +7	vnm 2025-04-03	7/350	2025-04-05 08:29 by lfhuang
[考研] 085602化学工程，273分 +18	青阳21st 2025-04-01	19/950	2025-04-04 19:01 by DNDYR
[考研] 315求调剂 +10	Wakaka@ 2025-03-31	10/500	2025-04-04 14:20 by cp872168381
[考研] 282求调剂 +3	非月不非 2025-04-04	3/150	2025-04-04 10:29 by 来看流星雨10
[考研] 材料调剂 +6	文文睡觉了 2025-04-03	6/300	2025-04-03 23:31 by yanenwang
[考研] 317求调剂 +5	小宋必定上岸 2025-04-03	5/250	2025-04-03 19:22 by lililifu
[考研] 材料与化工（085600）求调剂 +14	想上个好学校啊 2025-04-03	15/750	2025-04-03 19:14 by 雨晴月夜
[考研] 292求调剂 +4	2025417 2025-04-03	4/200	2025-04-03 18:01 by mg1014
[考研] 材料与化工 085600 +12	jiangaook 2025-03-31	12/600	2025-04-03 09:29 by oooqiao
[考研] 337分合工大材料求调剂 +7	可清风拂山岗 2025-04-01	8/400	2025-04-02 23:16 by zhangzhencsu
[考研] 材料考研学硕调剂 +8	小佘3 2025-04-01	8/400	2025-04-02 15:16 by Cloris-y
[考研] 341求调剂 +5	星辰般闪耀 2025-04-01	5/250	2025-04-02 11:33 by 阳光向上666
[考研] 一志愿303求调剂 +11	feiqiugui 2025-04-02	11/550	2025-04-02 10:42 by siwuhen
[考研] 303求调剂 +9	呀呀呀22882673 2025-04-01	9/450	2025-04-01 16:49 by 猪猪男孩2123
[考研] 材料专硕300求调剂 +4	18175019788 2025-03-31	4/200	2025-04-01 14:39 by 1104338198
[考研] 263求调剂，一志愿东北大学，学硕英一数二，孩子只求有个学上，求B区调剂 +9	步枪小米 2025-03-31	11/550	2025-04-01 01:25 by ainw?e?s
[考研] 313求调剂 +4	Pj. 2025-03-30	4/200	2025-03-30 17:35 by jakeatcug

24小时热门版块排行榜

minmin_0082003

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇 被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:查看全部散金贴

hakuna

hakuna

hakuna

第一性原理

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出

» 抢金币啦！回帖就可以得到:
查看全部散金贴