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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇 被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】优化的结构非常奇怪，Au10 簇 被优化成了4组小簇，为什么，输入及结构已贴出

用的网上贴出来的pesudopotential
输入文件如下
&CONTROL
  calculation    = "relax",
  prefix         = "iso0-Au10-t"
  nstep          = 150,
  pseudo_dir   = "/home/***/PWscf/Pseudo",
  outdir       = "/home/***/PWscf/outdir",
/
&SYSTEM
  nosym       = .TRUE.,
  ibrav       = 0,
  celldm(1)   = 1.0D0,
  nat         = 10,
  ntyp        = 1,
  ecutwfc     = 25.0D0,
  ecutrho     = 160.0D0,
  occupations = "smearing",
  degauss     = 0.01D0,
  smearing    = "gauss",
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.5D0,
/
&IONS
  bfgs_ndim         = 3,
  upscale           = 100.D0,
  pot_extrapolation = "second_order",
  wfc_extrapolation = "second_order",
/
ATOMIC_SPECIES
Au  196.96655  Au.blyp-mt.UPF
ATOMIC_POSITIONS { angstrom }
Au  0.351644000      0.323076000      0.020090000
Au  0.353167000     -2.459480000      0.001629000
Au  0.325466000     -5.209497000      0.021409000
Au -1.052830000     -1.054437000      1.988954000
Au -1.026740000      1.696543000      1.965435000
Au -1.051203000     -3.836601000      1.970273000
Au  1.727775000     -1.054277000     -1.924117000
Au  1.723939000     -3.829706000     -1.938591000
Au -2.418980000      0.317707000      3.931133000
Au -2.429430000     -2.457304000      3.913504000
K_POINTS {Gamma}
CELL_PARAMETERS { cubic }
  15.00000  0.00000  0.00000
   0.00000  15.00000  0.00000
   0.00000  0.00000  15.00000

输入文件是从高斯优化得到的

输出文件时PWscf得到的
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1楼 2010-12-17 11:39:54
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hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-12-23 09:50:38:
呵呵，对与Au团簇，如果没算过，是不能轻易下判断的，我看到一片文献好像是Au20，是金字塔形状，但中间是中空的。根据我自己的经验，以前对Au13作了检验，用模拟退火方法找出来的结构已经有呈中空状态的趋势了，原 ...

总感觉那样与常识相悖，能给出个令人信服的理由吗？
虽然空的金字塔里流荡着法老的幽灵，但那真的是最稳定结构吗？亦或是作者弄出来的玄虚？
不知道你用什么势函数退的火？SA理论上可以找到能量最低点，只是理论而已，相比之下，GA可能更好一些

[ Last edited by hakuna on 2010-12-23 at 19:41 ]
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13楼2010-12-23 19:32:52
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hakuna

木虫 (知名作家)
★ ★
zzy870720z(金币+2):鼓励交流 2010-12-19 11:41:23
minmin_0082003(金币+3):谢谢，原因已经解决，是因为pseudopotential的问题，但是为什么configure 不同得到结果不同还不清楚 2010-12-19 14:04:01
个人感觉初始结构不合理，你把六边形外面的两个Au放在六边形里两个相对空隙上面试试看，如果一定要优化出一个平面结构，建议把左侧Au原子位置下移，使之与左下侧连个Au原子形成三角形结构，这样对称性高一些.....
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2楼2010-12-19 10:26:47
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)
★
ellsaking(金币+1):写一写出了什么问题也让大家借鉴一下吧，哈哈~ 2010-12-22 09:57:08
原因已经找到， 问题初步解决
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-12-19 14:04:25
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yoghurt117

木虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢分享 2010-12-21 08:16:55
minmin_0082003(金币+1):谢谢，Au10 有很多的异构体，我算的是最稳定的一个 2010-12-21 09:31:22
曾经从网上找了个Au10的结构，跟你的好像不一样
Au    -.79776090   -.69523418   2.61154030
Au     .21885458   1.44933212   1.53546771
Au    1.72079748   -.80162079   1.64308518
Au   -2.27547260    .67789930    .81619191
Au    -.38520612  -1.04247831   -.00370155
Au    1.88256086    .84182724   -.50326931
Au    -.60370245   1.76230683  -1.01776187
Au    2.04405802  -1.73293814   -.87099203
Au   -2.20281778   -.16059519  -1.74977567
Au     .39868891   -.29849888  -2.46078469
可以算算看看
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4楼2010-12-21 00:07:57
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