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boylc789

木虫 (著名写手)


[交流] 【讨论】局部优化,固定不了原子

opt=z-matrix
坐标用的是笛卡尔坐标
C -1
O-1
C 0
。。。

但是看结构时冻结的原子坐标,位置变了
不知道是怎没回事
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boylc789

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2010-12-17 15:05:33:


仅用-1虽然可以固定原子,但GS为了分析对称性,却会挪动坐标系,将你的分子主平面由输入的xy改在xz进行,所以位置变了,但结果还是部分优化的。只有加了nosymm关键词,才不会挪动坐标按你的安排算。但你的分子 ...

分析的比较有道理,但是我觉得我这个不是这个原因
Maximum step size (   0.300) exceeded in Quadratic search.
    -- Step size scaled by   0.272
TrRot=  0.000006  0.000045 -0.000148  0.313378 -0.000001 -0.313378
MatCor failed.
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    X1       37.57900   1.51642   0.00000   0.00625   0.00626  37.58526
    Y1       17.84251  -1.42505   0.00000  -0.00741  -0.00740  17.83511
    Z1       14.24996   1.25329   0.00000   0.00699   0.00689  14.25685
    X2       37.57900   0.00116   0.00000  -0.00001  -0.00001  37.57899
    Y2       16.76023   0.14373   0.00000   0.00115   0.00116  16.76140
    Z2       16.76023   0.14363   0.00000   0.00131   0.00121  16.76144
    X3       36.28628   0.01445   0.00000   0.00012   0.00012  36.28640
    Y3       21.82588  -0.06877   0.00000  -0.00056  -0.00055  21.82533
    Z3       21.82588  -0.06878   0.00000  -0.00041  -0.00051  21.82537
    X4       37.57900  -0.00078   0.00000   0.00000   0.00000  37.57900
    Y4       18.78950   0.06728   0.00000   0.00049   0.00050  18.79000
    Z4       18.78950   0.06735   0.00000   0.00065   0.00055  18.79005
    X5       35.52719   0.04866   0.00000   0.00038   0.00038  35.52756
    Y5       19.85674  -0.03941   0.00000  -0.00032  -0.00031  19.85644
    Z5       19.85674  -0.03940   0.00000  -0.00021  -0.00031  19.85643
    X6       33.46786  -0.06602   0.00000  -0.00051  -0.00051  33.46735
这个地方都变了,每一个xyz都变了,变得幅度应该不是很大
9楼2010-12-17 15:26:04
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流! 2010-12-22 10:00:28
引用回帖:
Originally posted by boylc789 at 2010-12-17 11:18:51:
opt=z-matrix
坐标用的是笛卡尔坐标
C -1
O-1
C 0
。。。

但是看结构时冻结的原子坐标,位置变了
不知道是怎没回事

在我的印象中好像只有内坐标才可以局部优化吧!
2楼2010-12-17 11:46:42
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boylc789

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by hustyh0801 at 2010-12-17 11:46:42:

在我的印象中好像只有内坐标才可以局部优化吧!

我看其他人说的用frozen -1可以冻结的,而且gv里也提供这一选项
3楼2010-12-17 11:53:28
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by boylc789 at 2010-12-17 11:53:28:

我看其他人说的用frozen -1可以冻结的,而且gv里也提供这一选项

我还是建议用内坐标试下。
4楼2010-12-17 12:01:18
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