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【求助】继续求助doml计算过渡态的问题
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在拿dmol计算固体表面解离过渡态时我的流程是这样的： 1： 因为不知道确定的初态和终态位置所以我假定了一个初态和终态（从文献上看的大体在那个位置，精确的就不知道啦）进行reaction preview我先进行ts-confrimation在给出的1-2.xcd（1,2 表示假定的初态和终态）找到相对应的初态最低点11和终态最低点22。 2：优化11和22同时计算freq，确保11和22没有虚频也就是保证11 和22 结构很稳定。得到111和222 3：以111 和222做reaction preview进行ts-search计算频率（问题就出现在这，算出来三个虚频一个-1500多一个-200一个-70。-1500是我想要的振动模式其他两个都是平动幅度也很小） 问题一：我想消去那两个不想要的虚频，按照小木虫上的针对dmol消虚频的小程序，把原子做啦调整，我应该是计算能量和频率还是优化结构和频率？ 问题二：这个流程对不对？应该怎样做？ 设想二我这样做 1：因为不知道确定的初态和终态位置所以我假定了一个初态和终态（从文献上看的大体在那个位置，精确的就不知道啦）进行reaction preview我先进行ts-confrimation在给出的1-2.xcd（1,2 表示假定的初态和终态）找到相对应的初态最低点11和终态最低点22。 2：在11、22分别和ts-confrimation中最高点3进行ts-search看有没有能量最高的点虚频是不是一个 这两种方法那个好一些，还是两个都有问题啊？到底过渡态再没找啊？愁啊 [ Last edited by lishufei on 2010-12-16 at 10:26 ] |
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