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csfn

荣誉版主 (知名作家)


[交流] 【求助】100金币求助1个6个原子的ccsd(t)单点能计算

希望高手帮忙,用如下输入文件计算时候,出现502错误。加上xqc计算的时候,出现508错误死掉Error termination via Lnk1e in /export/home/g03 nda-exe/l508.exel
希望有朋友能帮忙指点下。急需这个能量
CODE:
%chk=NN2FeO-cs-3.chk
%nprocshared=4
%mem=500MW
%rwf=1,1990mb,2,1990mb,3,1990mb,4,1990mb,5,1990mb,6,1990mb
# ccsd(t,maxcycle=300)/6-311+g(d) scf(maxcycle=200) test nosymm

Title Card Required

0 3
Fe                -0.03212906    0.44447196   -0.10709781
N                 -1.26584642   -0.86991489   -0.01031481
N                  1.55875687   -0.51694044   -0.00668081
O                 -0.54419679    1.93529518    0.18492521
N                 -2.15779363   -1.55619275    0.09039120
N                  2.60615887   -0.91961369    0.11305320

引用回帖:
计算先用bp86/6311G*优化,然后读入chk文件,用ccsd(t)/6311G*单点计算,报错如下:

******************************************
Gaussian 03:  AM64L-G03RevD.01 13-Oct-2005
                12-Dec-2010
******************************************
%chk=m3bp86opt.chk
%nprocshared=4
Will use up to    4 processors via shared memory.
%mem=400MW
%rwf=1,1990mb,2,1990mb,3,1990mb,4,1990mb,5,1990mb,6,1990mb
----------------------------------------------------------------------
# ccsd(t,maxcyc=333)/6-311+g(d) scf(maxcycle=555) geom=check guess=rea
d
----------------------------------------------------------------------
1/29=2,38=1/1;
2/40=1/2;
3/5=4,6=6,7=11,11=9,16=1,25=1,30=1/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,7=555,38=6/2;
8/6=7,9=120000,10=2,27=1564999680/1,4;
9/5=7,6=333,14=2,27=1564999680/13;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
99/5=1,9=1/99;
-------------------
Title Card Required
-------------------
Redundant internal coordinates taken from checkpoint file:
m3bp86opt.chk
Charge =  0 Multiplicity = 3
Fe,0,0.0226601764,0.1864275665,0.0262809173
N,0,0.0202650182,0.0167807499,1.8234765312
N,0,1.8331063701,0.010407751,-0.369730851
O,0,-1.2857012235,0.831050927,-0.6392849237
N,0,-0.1503848176,-0.0189961357,2.9399421138
N,0,2.8818766172,0.0006213368,-0.7862326103
Recover connectivity data from disk.
                          Input orientation:                          
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1         26             0        0.022660    0.186428    0.026281
    2          7             0        0.020265    0.016781    1.823477
    3          7             0        1.833106    0.010408   -0.369731
    4          8             0       -1.285701    0.831051   -0.639285
    5          7             0       -0.150385   -0.018996    2.939942
    6          7             0        2.881877    0.000621   -0.786233
---------------------------------------------------------------------
                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  Fe   0.000000
     2  N    1.805186   0.000000
     3  N    1.861592   2.845451   0.000000
     4  O    1.603224   2.904097   3.236213   0.000000
     5  N    2.926015   1.129999   3.858631   3.849986   0.000000
     6  N    2.978224   3.872940   1.128489   4.252048   4.804100
                    6
     6  N    0.000000
Stoichiometry    FeN4O(3)
Framework group  C1[X(FeN4O)]
Deg. of freedom    12
Full point group                 C1
Largest Abelian subgroup         C1      NOp   1
Largest concise Abelian subgroup C1      NOp   1
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1         26             0       -0.032400    0.444952   -0.106911
    2          7             0       -1.265571   -0.869714   -0.008731
    3          7             0        1.557991   -0.517452   -0.007119
    4          8             0       -0.543139    1.936445    0.184502
    5          7             0       -2.156470   -1.557903    0.089206
    6          7             0        2.605123   -0.920691    0.112882
---------------------------------------------------------------------


…………………………


Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Restarting incremental Fock formation.
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Restarting incremental Fock formation.
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Matrix for removal 16 Erem= -1554.96348757654     Crem= 0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Restarting incremental Fock formation.
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
Rare condition: small coef for last iteration:  0.000D+00
>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(UHF) =  -1554.96374932     A.U. after  556 cycles
             Convg  =    0.1593D-03             -V/T =  1.9997
             S**2   =   2.9433
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     2.9433,   after     2.4329
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /export/home/caocao/g03/linda-exe/l502.exel at Sun Dec 12 16:13:40 2010.
Job cpu time:  0 days  0 hours 45 minutes 46.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     31 Int=      0 D2E=      0 Chk=      8 Scr=      1

[ Last edited by csfn on 2010-12-12 at 16:05 ]
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quantumor

金虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
csfn(金币+30):谢谢侯老师:) 2010-12-12 16:33:20
小红豆(金币+5):辛苦了 2010-12-14 15:40:42
由于只是很久前尝试过用CCSD(T)优化3个原子的体系,但因各种原因而没有最终完成,所以相关的经验甚少,以下意见进供楼主参考。
楼主的2个出错都源于SCF的问题,表面上看似乎都与磁盘大小无关。但仔细阅读帮助文件,分析似乎与磁盘空间有点联系。
1、由于楼主机器的节点够爽,可否将rwf%再多设置些?
2、楼主将每个读写文件限制在2G以内,难道用的是win系统?如果是win系统的话,设置那么大的内存,就必须要恰当的设置win系统的的环境变量,把允许系统使用的内存量加上去,否则计算会莫名其妙的出错。
3、尽管CCSD(T)计算无法通过MaxDisk限定磁盘用量,但在输入文件中设置“# MaxDisk=available-disk ”似乎是有必要的,因为Gaussian本身优化得并不是很好,超出一定限度后的后果难料。
4、尝试使用小基组作出单点保存chk文件,而后逐步加大基组,使用guess(read)作后续单点计算直到你的6-311++G(d)。
祝好运!
6楼2010-12-12 16:11:18
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quantumor

金虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+5):嗯嗯,我需要的是相对能量,有-4我就足够呢^_^ 2010-12-12 16:48:59
小红豆(金币+5):辛苦了 2010-12-14 15:40:57
实在不行的话,在#后加个P,读一下out文件,看SCF是在什么地方(多大的精度)以后就不再向继续收敛的方向计算了;然后,如果实在还不行,干脆将SCF精度降低一些,使SCF结果收敛,因为你要的是能量,如果能到10^-5甚至 10^-4也差不多了,在论文中说明一下应该没问题的。
9楼2010-12-12 16:41:56
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