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暖秋

新虫 (小有名气)


[交流] 【求助】求详细的PWscf并行编译过程(越详细越好,包括各种环境和参数的设置,及软件�

大家好,我按照有关PWscf并行编译的过程在机群上并行编译了PWscf,没有出现错误,并行环境也检测没问题。但计算的时候发现并没有并行。我不懂这个,发现不了到底错在哪里了。想求教一个详细的编译过程,越详细越好,请各位帮帮我,谢谢了。。。
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暖秋

新虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-07 12:16:00:


这次不能并行是什么提示?

下面是建立任务后的输出:
提示是并行的,但是我检查节点的时候发现并没有并行,只是在一个cpu上算。而且一个cpu的利用率也不高,您看看可能会是什么原因?

Program PHONON v.4.2       starts on  7Dec2010 at 10:21:52

     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
     for quantum simulation of materials; please acknowledge
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
          URL http://www.quantum-espresso.org",
     in publications or presentations arising from this work. More details at
     http://www.quantum-espresso.org/ ... ng_Quantum-ESPRESSO

     Parallel version (MPI), running on     4 processors
     R & G space division:  proc/pool =    4

     Ultrasoft (Vanderbilt) Pseudopotentials
     file Co.pbe-nd-rrkjus.UPF: wavefunction(s)  4S 3D renormalized
     file O.pbe-rrkjus.UPF: wavefunction(s)  2S renormalized

     Planes per process (thick) : nr3 = 120 npp =   30 ncplane =  1024
     Planes per process (smooth): nr3s=  75 npps=   19 ncplanes=   400

     Proc/  planes cols     G    planes cols    G      columns  G
     Pool       (dense grid)       (smooth grid)      (wavefct grid)
        1    30    159    12403   19     60     2860     22      634
        2    30    160    12408   19     60     2846     21      621
        3    30    159    12405   19     61     2859     21      623
        4    30    159    12403   18     60     2848     21      625
     tot    120    637    49619   75    241    11413     85     2503
13楼2010-12-07 12:24:16
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查看全部 30 个回答
★
暖秋(金币+1): 2010-12-06 10:54:03
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-05-11 20:45:37
pwscf编译应该很简单
既然已经编译上去了
可以说一下你的错误
大家帮你看一下错误
2楼2010-12-05 23:03:08
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暖秋

新虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-05 23:03:08:
pwscf编译应该很简单
既然已经编译上去了
可以说一下你的错误
大家帮你看一下错误

mpif90  -o gww.x \
        gww.o basic_structures.o compact_product.o create_hf.o create_quasi_particle.o energies_gww.o expansion.o fft_gw.o fit_multipole.o fit_polynomial.o go_dressed_w.o go_exchange.o go_fft.o go_green.o go_polarization.o green_function.o gv_time.o input_gw.o para_gww.o polarization.o read_data_pw.o remainder.o self_energy.o self_energy_storage.o start_end.o times_gw.o vcprim.o  ../../Modules/libqemod.a ../../iotk/src/libiotk.a ../../flib/flib.a ../../clib/clib.a ../../flib/ptools.a ../../Multigrid/mglib.a  -lmkl_lapack  -L/home/software/intel/mkl/8.0/lib/em64t/ -lguide -lmkl -llapack -lvml     ../minpack/minpacklib.a
( cd ../../bin; ln -fs ../GWW/gww/gww.x . )
mpif90 -O2 -assume byterecl -g -traceback -nomodule -fpp -D__INTEL -D__FFTW -D__MPI -D__PARA -I../../include -I../../iotk/src -I../../Modules -I../../EE -I../pw4gww -I. -c gww_fit.f90
mpif90  -o gww_fit.x \
gww_fit.o basic_structures.o compact_product.o create_hf.o create_quasi_particle.o energies_gww.o expansion.o fft_gw.o fit_multipole.o fit_polynomial.o go_dressed_w.o go_exchange.o go_fft.o go_green.o go_polarization.o green_function.o gv_time.o input_gw.o para_gww.o polarization.o read_data_pw.o remainder.o self_energy.o self_energy_storage.o start_end.o times_gw.o vcprim.o  ../../Modules/libqemod.a ../../iotk/src/libiotk.a ../../flib/flib.a ../../clib/clib.a ../../flib/ptools.a ../../Multigrid/mglib.a  -lmkl_lapack  -L/home/software/intel/mkl/8.0/lib/em64t/ -lguide -lmkl -llapack -lvml     ../minpack/minpacklib.a
( cd ../../bin; ln -fs ../GWW/gww/gww_fit.x . )
make[2]: Leaving directory `/home/software/PW/PW1/espresso-4.2/GWW/gww'
make[1]: Leaving directory `/home/software/PW/PW1/espresso-4.2/GWW'
if test -d TDDFPT ; then \
( cd TDDFPT ; if test "make" = "" ; then make  TLDEPS= all ; \
else make  TLDEPS= all ; fi ) ; fi
请各位看看,这是什么原因?
3楼2010-12-06 10:53:52
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暖秋(金币+1): 2010-12-06 16:35:02
引用回帖:
Originally posted by 暖秋 at 2010-12-06 10:53:52:

mpif90  -o gww.x \
        gww.o basic_structures.o compact_product.o create_hf.o create_quasi_particle.o energies_gww.o expansion.o fft_gw.o fit_multipole.o fit_polynomial.o go_dressed_w.o go_exchange ...

没有报错啊
4楼2010-12-06 10:55:57
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