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adslye

银虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1):鼓励积极参与解答~ 2010-12-07 14:21:53
引用回帖:
Originally posted by 惟我独尊 at 2010-12-03 20:20:52:

我的模板长度为200BP 引物为细菌V3区引物 341F和534R 程序如下: 94预变性 4 min ;94 变性1 min 55 退火 1 min  72延伸 1 min ,30 个循环 最后72 延伸 6分钟

退火和延伸都换成30s, 换高保真酶试试。模板稀释使用。
模板好短,问题应该出在这了。

试试吧,做了后把结果发上来,大家一起分享。
21楼2010-12-03 23:26:13
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惟我独尊

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by adslye at 2010-12-03 23:26:13:


退火和延伸都换成30s, 换高保真酶试试。模板稀释使用。
模板好短,问题应该出在这了。

试试吧,做了后把结果发上来,大家一起分享。

好滴 回头重做传上来 谢谢大家
22楼2010-12-04 10:13:32
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YaYa785

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1):鼓励积极参与解答~ 2010-12-07 14:21:28
引用回帖:
Originally posted by 惟我独尊 at 2010-12-03 20:20:52:

我的模板长度为200BP 引物为细菌V3区引物 341F和534R 程序如下: 94预变性 4 min ;94 变性1 min 55 退火 1 min  72延伸 1 min ,30 个循环 最后72 延伸 6分钟

你的模板是200bp?
那你的目的片段是多大啊?
退火时间和延伸时间是根据你的目的片段大小定的,预测你这两步程序的时间太长....
还有你说的模板量4微升是pcr的模板量?太多了,50的体系1微升就很多了,若你的模板很浓,更应该稀释之后再加....pcr模板浓度时有规定的,细菌酵母质粒都不一样的...分子克隆上有,你查查...
23楼2010-12-07 12:55:11
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惟我独尊

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by YaYa785 at 2010-12-07 12:55:11:



你的模板是200bp?
那你的目的片段是多大啊?
退火时间和延伸时间是根据你的目的片段大小定的,预测你这两步程序的时间太长....
还有你说的模板量4微升是pcr的模板量?太多了,50的体系1微升就很多了,若 ...

谢谢  我的模板是200bp 目的片段也是200bp啊  因为我的模板是从DGGE胶中提取出的 浓度应该很小 所以旧多加了点  我按照你的建议改进PCR程序再试一次吧 灰常感谢
24楼2010-12-07 15:16:46
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YaYa785

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 惟我独尊 at 2010-12-07 15:16:46:

谢谢  我的模板是200bp 目的片段也是200bp啊  因为我的模板是从DGGE胶中提取出的 浓度应该很小 所以旧多加了点  我按照你的建议改进PCR程序再试一次吧 灰常感谢

胶回收用纯水吧   有时候洗脱液中的盐离子也会影响pcr的...
25楼2010-12-08 11:05:53
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huweicheng

木虫 (小有名气)

DAD


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1。PCR产物降解 2。 引物设计有问题。
ADFAS
26楼2010-12-08 11:13:31
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yaushz

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):谢谢参与 2010-12-08 12:37:05
smear,很有可能是降解,比如我提取凋亡或坏死细胞DNA跑出来就这个样子——!
27楼2010-12-08 11:32:12
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李战士

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
545596楼: Originally posted by 惟我独尊 at 2010-12-04 10:13:32
好滴 回头重做传上来 谢谢大家...

最后咋样了啊,怎么解决的呢?
其实有很多事我们都知道,只是不愿意说出来
28楼2012-06-05 23:55:42
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