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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】linux 系统MS 如何运行
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sss3012

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】linux 系统MS 如何运行

我在linux 系统上安装了MS5.0，不知道是否安装成功想运行测试一下，请问Linux系统如何运行MS，我以前在Window 系统上装过，有快捷方式运行也很方便，如果在Linux 运行CASTEP应该执行哪个文件？请给些建议
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1楼 2010-12-01 16:04:51
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

y.q.liu

金虫 (小有名气)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-01 23:28:44
sss3012(金币+2): 2010-12-02 08:09:47
引用回帖:
Originally posted by sss3012 at 2010-12-01 16:04:51:
我在linux 系统上安装了MS5.0，不知道是否安装成功想运行测试一下，请问Linux系统如何运行MS，我以前在Window 系统上装过，有快捷方式运行也很方便，如果在Linux 运行CASTEP应该执行哪个文件？请给些建议

你可以在windows下提交计算的，在客户端添加服务器后基本上就可以象在windows下本机上算差不多。
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2楼2010-12-01 21:47:48
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nextnest

木虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+3):谢谢详细指教 2010-12-03 14:01:48
引用回帖:
Originally posted by fdtdpc at 2010-12-03 09:52:05:



如何在在linux环境下直接在服务器上计算？

一、第一种方案（针对CASTEP）
1. 首先在Windows的MS5.0界面下搭建相关模型，并且在Calculation对话框中进行相关设置；
2. 完成设置后，请按下Calculation对话框下方的Files按钮，选择Save Files；
3. 使用Windows文件管理器打开相应的文档，在该目录下能够看到带有以下后缀的文件：.cell、.param，请将此文件拷贝到Linux的MS安装目录下的/etc/CASTEP/bin目录下；
4. 打开.cell文件，在
%BLOCK SPECIES_POT
Al  Al_00.recpot
%ENDBLOCK SPECIES_POT
中可以看到所使用的赝势，进入Windows下的（如：(C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio 5.0\share\Resources\Quantum\Castep\Potentials\ )），找到这些赝势文件，并将其拷贝到Linux的MS安装目录下的/etc/CASTEP/bin目录下
5. 进入Linux系统，选定这些文件，点击右键，在权限选项中修改这些文件的权限为可执行、可读写，并运行以下命令执行相关
计算：
cd /home//bin/  切换路径至RunCASTEP.sh 所在路径
    ：CASTEP安装的绝对路径，例如/home/msi/ms/CASTEP/

./RunCASTEP.sh -np n 文件名  （如Al Al_BandStr Al_DOS 无需后缀）
-np n 使用多CPU进行并行计算，如果是单CPU，则不用此注释；如果使用多CPU，则需要使用，例如使用双CPU，则为 -np 2 （-np是关键词，不能修改）。
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8楼2010-12-03 10:29:40
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sss3012

银虫 (正式写手)
window 系统下如何向linux提交任务，能否讲详细些，谢谢你的帮助
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3楼2010-12-02 08:11:02
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huweny87

木虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-12-02 11:53:16
Tools->server console，然后把linux主机添加到服务器列表，在提交任务的时候，jobs control选项卡中选择linux主机。还有一种方式也可以看linux主机是否正常运行，在浏览器中输入http://ip_of_linux_server:18888, 其中的ip_of_linux_server用linux主机的ip代替，如果端口不是默认的，也要改一下。看看是否有一个这台机器安装了什么模块之类的一个网页出现。
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4楼2010-12-02 10:21:50
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
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引用回帖:
Originally posted by huweny87 at 2010-12-02 10:21:50:
Tools->server console，然后把linux主机添加到服务器列表，在提交任务的时候，jobs control选项卡中选择linux主机。还有一种方式也可以看linux主机是否正常运行，在浏览器中输入[url]http://ip_of_linux_serv ...

能否详细介绍一下如何把linux主机添加到服务器列表？ 多谢多谢！
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5楼2010-12-02 10:52:15
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)
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zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-12-03 14:01:20
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2010-12-02 10:52:15:


能否详细介绍一下如何把linux主机添加到服务器列表？ 多谢多谢！

“tools”-server console
在里面选择服务器管理 右键 新建server gateway 添加即可
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6楼2010-12-03 01:47:32
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fdtdpc

木虫 (著名写手)
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Originally posted by y.q.liu at 2010-12-01 21:47:48:

你可以在windows下提交计算的，在客户端添加服务器后基本上就可以象在windows下本机上算差不多。

如何在在linux环境下直接在服务器上计算？
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7楼2010-12-03 09:52:05
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y.q.liu

金虫 (小有名气)
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zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-07 23:16:20
引用回帖:
Originally posted by sss3012 at 2010-12-02 08:11:02:
window 系统下如何向linux提交任务，能否讲详细些，谢谢你的帮助

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2651222&pid=459416&page=1#pid459416
那是我的另外一个回帖，希望有所帮助，如果还不行可联系我。
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9楼2010-12-07 21:29:05
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nodding

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
向楼上高手请教个问题。

通过windows 客户端向 linux 服务器提交任务后， 而windows和linux 通信有问题，也就是 linux服务器计算完任务后，不能在windows 客户端实时更新，请问怎样使linux服务器计算完的数据在window客户端更新？
我下载后，不能更新windows的可视化界面。
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10楼2011-12-25 11:39:24
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18691405967

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不好意思啦，，能不能告诉我你是如何安装的
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11楼2015-06-09 11:08:16
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ltt20144015

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1 需要生成可计算的文件（将run变为save files），然后将该文件夹提交到linux系统
2 需要一个提交的脚本文件
3 cd 文件夹名
4 vi 脚本文件（文件名不能有空格和特殊符号）
5 qsub 脚本文件
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12楼2016-05-13 09:42:24
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