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sss3012

银虫 (正式写手)


[交流] 【求助】linux 系统MS 如何运行

我在linux 系统上安装了MS5.0,不知道是否安装成功想运行测试一下,请问Linux系统如何运行MS,我以前在Window 系统上装过,有快捷方式运行也很方便,如果在Linux 运行CASTEP应该执行哪个文件?请给些建议
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y.q.liu

金虫 (小有名气)



sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-01 23:28:44
sss3012(金币+2): 2010-12-02 08:09:47
引用回帖:
Originally posted by sss3012 at 2010-12-01 16:04:51:
我在linux 系统上安装了MS5.0,不知道是否安装成功想运行测试一下,请问Linux系统如何运行MS,我以前在Window 系统上装过,有快捷方式运行也很方便,如果在Linux 运行CASTEP应该执行哪个文件?请给些建议

你可以在windows下提交计算的,在客户端添加服务器后基本上就可以象在windows下本机上算差不多。
2楼2010-12-01 21:47:48
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nextnest

木虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3):谢谢详细指教 2010-12-03 14:01:48
引用回帖:
Originally posted by fdtdpc at 2010-12-03 09:52:05:



如何在在linux环境下直接在服务器上计算?

一、第一种方案(针对CASTEP)
1. 首先在Windows的MS5.0界面下搭建相关模型,并且在Calculation对话框中进行相关设置;
2. 完成设置后,请按下Calculation对话框下方的Files按钮,选择Save Files;
3. 使用Windows文件管理器打开相应的文档,在该目录下能够看到带有以下后缀的文件:.cell、.param,请将此文件拷贝到Linux的MS安装目录下的/etc/CASTEP/bin目录下;
4. 打开.cell文件,在
%BLOCK SPECIES_POT
Al  Al_00.recpot
%ENDBLOCK SPECIES_POT
中可以看到所使用的赝势,进入Windows下的(如:(C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio 5.0\share\Resources\Quantum\Castep\Potentials\ )),找到这些赝势文件,并将其拷贝到Linux的MS安装目录下的/etc/CASTEP/bin目录下
5. 进入Linux系统,选定这些文件,点击右键,在权限选项中修改这些文件的权限为可执行、可读写,并运行以下命令执行相关
计算:
cd /home//bin/  切换路径至RunCASTEP.sh 所在路径
    :CASTEP安装的绝对路径,例如/home/msi/ms/CASTEP/

./RunCASTEP.sh -np n 文件名  (如Al Al_BandStr Al_DOS 无需后缀)
-np n 使用多CPU进行并行计算,如果是单CPU,则不用此注释;如果使用多CPU,则需要使用,例如使用双CPU,则为 -np 2 (-np是关键词,不能修改)。
8楼2010-12-03 10:29:40
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普通回帖

sss3012

银虫 (正式写手)


window 系统下如何向linux提交任务,能否讲详细些,谢谢你的帮助
3楼2010-12-02 08:11:02
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huweny87

木虫 (小有名气)


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zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-12-02 11:53:16
Tools->server console,然后把linux主机添加到服务器列表,在提交任务的时候,jobs control选项卡中选择linux主机。还有一种方式也可以看linux主机是否正常运行,在浏览器中输入http://ip_of_linux_server:18888, 其中的ip_of_linux_server用linux主机的ip代替,如果端口不是默认的,也要改一下。看看是否有一个这台机器安装了什么模块之类的一个网页出现。
4楼2010-12-02 10:21:50
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by huweny87 at 2010-12-02 10:21:50:
Tools->server console,然后把linux主机添加到服务器列表,在提交任务的时候,jobs control选项卡中选择linux主机。还有一种方式也可以看linux主机是否正常运行,在浏览器中输入[url]http://ip_of_linux_serv ...

能否详细介绍一下如何把linux主机添加到服务器列表? 多谢多谢!
5楼2010-12-02 10:52:15
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zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-12-03 14:01:20
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2010-12-02 10:52:15:


能否详细介绍一下如何把linux主机添加到服务器列表? 多谢多谢!

“tools”-server console
在里面选择服务器管理 右键 新建server gateway 添加即可
6楼2010-12-03 01:47:32
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fdtdpc

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by y.q.liu at 2010-12-01 21:47:48:

你可以在windows下提交计算的,在客户端添加服务器后基本上就可以象在windows下本机上算差不多。

如何在在linux环境下直接在服务器上计算?
7楼2010-12-03 09:52:05
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y.q.liu

金虫 (小有名气)


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zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-07 23:16:20
引用回帖:
Originally posted by sss3012 at 2010-12-02 08:11:02:
window 系统下如何向linux提交任务,能否讲详细些,谢谢你的帮助

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2651222&pid=459416&page=1#pid459416
那是我的另外一个回帖,希望有所帮助,如果还不行可联系我。
9楼2010-12-07 21:29:05
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nodding

木虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
向楼上高手请教个问题。

通过windows 客户端向 linux 服务器提交任务后, 而windows和linux 通信有问题,也就是 linux服务器计算完任务后,不能在windows 客户端实时更新,请问怎样使linux服务器计算完的数据在window客户端更新?
我下载后,不能更新windows的可视化界面。
10楼2011-12-25 11:39:24
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18691405967

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不好意思啦,,能不能告诉我你是如何安装的
11楼2015-06-09 11:08:16
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ltt20144015

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1 需要生成可计算的文件(将run变为save files),然后将该文件夹提交到linux系统
2 需要一个提交的脚本文件
3 cd 文件夹名
4 vi 脚本文件(文件名不能有空格和特殊符号)
5 qsub 脚本文件
12楼2016-05-13 09:42:24
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