应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 基础理论 » 【求助】如何将文献中的原子坐标转换为晶体结构
101/1返回列表
查看: 1612  |  回复: 9
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】如何将文献中的原子坐标转换为晶体结构


space group C2/C

请问应该用什么软件 具体怎么操作
并存为其他格式的文件 如 PDB XYZ
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2010-11-28 18:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recen

木虫 (文坛精英)
mark一下 这个我也想知道
有这个软件的话 麻烦传上来 大家分享
赞一下 回复此楼
2楼2010-11-28 20:20:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fani0

银虫 (初入文坛)
childsliu(金币+2):谢谢 2010-11-29 09:51:50
用diamond不行么
赞一下 回复此楼
3楼2010-11-28 22:56:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
childsliu(金币+5):但是打开的cif文件只能显示晶胞里面的一部分 而不是全部显示这个晶胞 不知道怎么补全 2010-11-29 09:52:54
这个可以用diamond，把空间群和坐标输进去然后生成结构，但是很麻烦，你要一个一个的输入。还有一种方法就是去CCDC里面把cif文件下载下来，直接用diamond打开就行了。。。
赞一下 回复此楼
4楼2010-11-28 23:19:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juzi121

金虫 (正式写手)
嗯，楼上分析很到位
赞一下 回复此楼
5楼2010-11-29 09:01:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fani0

银虫 (初入文坛)
childsliu(金币+2):谢谢 2010-11-30 15:22:14
cif文件有时候会有问题  其实一个一个输也不错啊  可以仔细检查
赞一下 回复此楼
6楼2010-11-29 22:02:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
childsliu(金币+3):应该是这样的 这部分经过一些对称操作 才能填充为一个晶胞 但不知道如何充满 2010-11-30 15:22:04
你指的是结构的对称性太高么，所以只显示一部分？

可以把stereo打开看看
赞一下 回复此楼
7楼2010-11-29 22:32:54
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
childsliu(金币+3):好像还是不行 如果方便的话 看下CIF文件 2010-12-01 10:51:57
如果是对称性太高的话，即使你输入所有的原子坐标，还是只有一部分才对。所以你要打开stereo。估计会解决这个问题
赞一下 回复此楼
8楼2010-12-01 00:13:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)
CIF文件
http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=10313242bxglt7q8aba5v5za
赞一下 回复此楼
9楼2010-12-01 10:52:06
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
你这个分子好大啊，应该是好多的重复单元，你应该是只有一部分就够了···
赞一下 回复此楼
10楼2010-12-01 11:36:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 childsliu 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭