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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】含时密度泛函计算金团簇的激发态输出出错
汕头大学海洋科学接受调剂
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】含时密度泛函计算金团簇的激发态输出出错 已有5人参与

我计算的是两个金原子的二聚体，计划利用含时密度泛函算它激发态的能量和振荡强度（重复别人的工作练习gaussian），运行后，输出文件有错误信息，没有正常结束！运行在服务器上的，g09-linux版。
         哪位同学帮忙看看，可能比较低级，还望指点一二呀！谢谢！
  
   附 输入文件：

%chk=au2.chk
%rwf=au2.rwf
%mem=2GB
#p pw91/LANL2DZ  td(Triplets,nstates=5)

The TD calc of au2

0  1
Au 0.00 0.00 0.00
Au 2.55 0.00 0.00



附 输出文件如下：

Gaussian 09:  EM64L-G09RevA.01  8-May-2009
                28-Nov-2010
******************************************
%chk=au2.chk
%rwf=au2.rwf
%mem=2GB
--------------------------------------
#p pw91/LANL2DZ td(Triplets,nstates=5)
--------------------------------------
QPErr --- An ambiguous keyword was detected.
#p pw91/LANL2DZ td(Triplets,nstates=5)
    '
Last state="DFT"
TCursr=19940 LCursr=    3
Error termination via Lnk1e in /home/bjwang/g09/l1.exe at Sun Nov 28 15:55:44 2010.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
1楼 2010-11-28 16:43:25
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★
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QPErr --- An ambiguous keyword was detected.
#p pw91/LANL2DZ td(Triplets,nstates=5)
错误在此，楼主查查手册有这个泛函组合吗？
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前途光明，出路难觅！
2楼2010-11-28 17:27:00
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
我是看文献上采用的这个组合的：
“To assess the quality of the method, we calculate the five
lowest excitation energies of gold dimer at the level of PW91
with the LANL2DZ basis set”

     我在手册上确实没见到过这个组合，但我在网上搜了一下，也有好多人用呀
http://www.google.com.hk/search? ... p;q=pw91%2FLANL2DZ+

     pw91是DFT 方法的关键字，Gaussian内置的Lanl2dz基组是使用最广泛的ECP基组之一，广泛用于包含过渡金属体系的计算。

[ Last edited by bjwang on 2010-11-28 at 18:01 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
3楼2010-11-28 17:57:46
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★
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lanl2dz 不能直接写，要gen，pesudo=read...
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
4楼2010-11-28 18:15:27
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
楼主说的有些麻烦呀，我参考例子test405.com（#p pw91PW91 6-31g(d,p) opt=tight freq test）和例子test588.com（#p pbepbe/lanl2dz opt=(modred,expert) test
），把上面的改为：
#p pw91pw91/LANL2DZ  td(Singlets,nstates=25)
可以正常运行了，但结果和文献的好像不太一致。

我把一部分结果贴出来，还望大家帮忙指点一二,谢谢！

附计算结果：
Excitation energies and oscillator strengths:

Excited State   1:      Singlet-SGG    2.4542 eV  505.20 nm  f=0.0000  =0.000
      19 -> 20         0.70804
This state for optimization and/or second-order correction.
Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) =  -270.944678611
Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density.

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   2:      Singlet-?Sym    2.4692 eV  502.12 nm  f=0.0068  =0.000
      16 -> 20         0.54652
      17 -> 20         0.44957

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   3:      Singlet-?Sym    2.4692 eV  502.12 nm  f=0.0068  =0.000
      16 -> 20        -0.44957
      17 -> 20         0.54652

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   4:      Singlet-?Sym    2.5208 eV  491.85 nm  f=0.0000  =0.000
      15 -> 20         0.70723

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   5:      Singlet-?Sym    2.5208 eV  491.84 nm  f=0.0000  =0.000
      14 -> 20         0.70723

Excited State   6:      Singlet-SGU    2.8115 eV  440.99 nm  f=0.1547  =0.000
       9 -> 20        -0.13683
      18 -> 20         0.69666
Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   7:      Singlet-?Sym    2.8126 eV  440.81 nm  f=0.0000  =0.000
      13 -> 20         0.70718

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   8:      Singlet-?Sym    2.8127 eV  440.80 nm  f=0.0000  =0.000
      12 -> 20         0.70718

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State   9:      Singlet-?Sym    3.8587 eV  321.31 nm  f=0.0000  =0.000
      11 -> 20         0.70619

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  10:      Singlet-?Sym    3.8587 eV  321.31 nm  f=0.0000  =0.000
      10 -> 20         0.70619

Excited State  11:      Singlet-SGU    5.2842 eV  234.63 nm  f=0.0181  =0.000
       9 -> 20         0.47641
      16 -> 21        -0.36704
      17 -> 22        -0.36704

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  12:      Singlet-?Sym    5.4335 eV  228.19 nm  f=0.0000  =0.000
      19 -> 22         0.68975
symmetry could not be determined.
Excited State  13:      Singlet-?Sym    5.4335 eV  228.19 nm  f=0.0000  =0.000
      19 -> 21         0.68975

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  14:      Singlet-?Sym    5.4625 eV  226.98 nm  f=0.0000  =0.000
      16 -> 21         0.49989
      17 -> 22        -0.49989

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  15:      Singlet-?Sym    5.4625 eV  226.97 nm  f=0.0000  =0.000
      16 -> 22         0.49989
      17 -> 21         0.49989

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  16:      Singlet-?Sym    5.4661 eV  226.82 nm  f=0.0000  =0.000
      16 -> 22        -0.50000
      17 -> 21         0.50000

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  17:      Singlet-?Sym    5.6570 eV  219.17 nm  f=0.0000  =0.000
      14 -> 22        -0.49989
      15 -> 21         0.50005

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  18:      Singlet-?Sym    5.6570 eV  219.17 nm  f=0.0000  =0.000
      14 -> 21         0.49989
      15 -> 22         0.50005

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  19:      Singlet-?Sym    5.7361 eV  216.15 nm  f=0.1459  =0.000
      12 -> 22        -0.26016
      13 -> 21        -0.26020
      18 -> 21         0.53933
      18 -> 22        -0.20694

Excited state symmetry could not be determined.
Excited State  20:      Singlet-?Sym    5.7361 eV  216.15 nm  f=0.1459  =0.000
      12 -> 21        -0.26016

.................................................................

文献上给的五个最低的the energies of excited states 分别为：2.47,2.82，3.87，
5.28,5.74。振子强度分别为：0.01,0.15,0.00,0.02,0.15
      
       看结果里面第2激发态（激发能2.469，振子强度0.0068）；
                                         6（2.8115,0.1547）；
                                        9（3.8587,0.000）；
                                         11（5.2842,0.118）；
                                          19（5.7361,0.1459）。
这五个无论是能量还是强度和文献上的基本完全符合，但是文献上说是五个最低的the energies of excited states，这是里面跳出来的，还有更低的，算法有问题还是结果分析有问题呢？

    现在我还有点疑惑就是文献上的the energies of excited states和计算输出中的Excitation energies 是一样的吗？激发态的能量和激发能量？感觉激发态的能量应该等于基态的能量加上激发能量，还望各位兄弟给予指导呀！！

[ Last edited by bjwang on 2010-11-29 at 11:25 ]
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5楼2010-11-28 20:59:57
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renxingye

铁杆木虫 (小有名气)
★
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#p pw91/LANL2DZ td(Triplets,nstates=5)
--------------------------------------
QPErr --- An ambiguous keyword was detected.
#p pw91/LANL2DZ td(Triplets,nstates=5)
    '
输出文件已经告诉你错在哪里



'  前面的部分就是出错的地方。

Lanldz 不是这样用的
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6楼2010-11-29 13:04:06
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢兄弟回复，我是参考test588练习写的：
#p pbepbe/lanl2dz opt=(modred,expert) test

Gaussian Test Job 588:
Al 2D lattice

0,1
Al,0,-1.0562022822,-1.0562022822,0.
Al,0,1.0562022822,1.0562022822,0.
-2,0,4.2245914921,0.,0.
-2,0,0.,4.2245914921,0.

* * * * K


正确的写法是这样吗？
#p pw91/Genecp pseudo=read     td(Triplets,nstates=5)

The TD calc of au2

0  1
Au 0.00 0.00 0.00
Au 2.55 0.00 0.00

Au 0
Lanl2DZ
****

Au 0
Lanl2DZ


但是有人说如果所有的分子都是LANL2DZ 的话，直接就用LANL2DZ 关键字就好了 http://www.mdbbs.org/archiver/tid-10319.html

这两种写法有区别吗？还是我那种写法就不对？
谢谢，才开始看高斯，好多地方不懂，麻烦大家了！

[ Last edited by bjwang on 2010-11-29 at 13:54 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
7楼2010-11-29 13:34:02
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ykwang

金虫 (正式写手)
★
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问题不在LanL2DZ的写法是否正确，而是出在PW91上。因为PW91既可以指交换泛函也可以指相关泛函，故单独写PW91含义不明确。而PW91PW91的含义是明确的，即交换和相关均为PW91。
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Nothing_Is_Impossible!
8楼2010-11-29 14:13:15
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
关于pw91的问题，我看手册也知道了交换泛函和相关泛函的结合使用。
但是如果这些都正确的话（#p pw91pw91/LANL2DZ  td(Singlets,nstates=25)

兄弟能否帮忙解释一下5楼的相关问题，我是按照文献的参数设置的，但结果差别比较大呀，原因有可能出在哪？能否解释或指点一下，谢谢！
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
9楼2010-11-29 15:17:53
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