| 查看: 694 | 回复: 1 | |||
[交流]
【求助】在oniom计算中amber电荷是怎么得到的
|
|
在oniom计算中C-CA--0.25 的-0.25电荷是怎么得到的呢？谢谢 example： # ONIOM(B3LYP/6-31G(d):Amber) Geom=Connectivity 2 layer ONIOM job 0 1 0 1 0 1 C-CA--0.25 0 -4.703834 -1.841116 -0.779093 L C-CA--0.25 0 -3.331033 -1.841116 -0.779093 L H-HA-0.1 3 C-CA--0.25 0 -2.609095 -0.615995 -0.779093 H C-CA--0.25 0 -3.326965 0.607871 -0.778723 H C-CA--0.25 0 -4.748381 0.578498 -0.778569 H C-CA--0.25 0 -5.419886 -0.619477 -0.778859 L H-HC-0.1 5 H-HA-0.1 0 -0.640022 -1.540960 -0.779336 L H-HA-0.1 0 -5.264565 -2.787462 -0.779173 L H-HA-0.1 0 -2.766244 -2.785438 -0.779321 L C-CA--0.25 0 -1.187368 -0.586452 -0.779356 L H-HA-0.1 3 C-CA--0.25 0 -2.604215 1.832597 -0.778608 H H-HA-0.1 0 -5.295622 1.532954 -0.778487 H H-HA-0.1 0 -6.519523 -0.645844 -0.778757 L C-CA--0.25 0 -1.231354 1.832665 -0.778881 L H-HC-0.1 11 C-CA--0.25 0 -0.515342 0.610773 -0.779340 L H-HA-0.1 0 -3.168671 2.777138 -0.778348 H H-HA-0.1 0 -0.670662 2.778996 -0.779059 L H-HA-0.1 0 0.584286 0.637238 -0.779522 L |
回复此楼» 猜你喜欢
北京工业大学材料科学与工程学院《院士团队》招收工程专业博士研究生（计算优先）
已经有1人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有87人回复
-
帮导师招2026CSC博士（巴塞罗那自治大学UAB-CSC博士项目）
已经有25人回复
-
有没有LIMS客户的资源，求推荐
已经有0人回复
-
福州大学梁宇航副教授招收2026年申核制博士研究生/硕士研究生（理论计算方向）
已经有21人回复
-
福州大学梁宇航副教授招收2026年申核制博士研究生/硕士研究生（理论计算方向）
已经有20人回复
-
深圳理工大学招聘AI4Science与分子模拟方向科研人员
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp如何计算差分电荷密度
已经有7人回复
- oniom中配体分子的amber力场
已经有4人回复
- 请教有机分子中O原子和H原子电荷数怎么计算，O-H键键级怎么计算！谢谢！
已经有4人回复
- 高斯计算中离子电荷的处理
已经有15人回复
- 怎样计算电极有效面积呢？是和电荷还有电荷密度有关吧？多谢指教
已经有7人回复
- 【求助】请问Gaussian计算带电荷有机物时电荷和自旋多重度如何选择
已经有18人回复
- 【求助成功】supercell中DOS计算如何得到合理的电荷密度和波函数？
已经有3人回复
- 【求助】DMOL中的电荷计算
已经有6人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
多功能 电子微生物生长分析仪 及 微生物快检技术开发服务
+2/148
-
Postdoctoral Research Fellow Position in Causal Inference Weill CorneIl Medicine
+1/92
-
天津科技大学邓启良教授团队 招收2026年博士生
+1/80
-
结构动力学与结构健康监测方向欧盟玛丽居里全奖博士招聘
+1/78
-
中国海洋大学与中国水产科学研究院 联合培养 专硕 食品加工与安全
+1/75
-
娃娃们今儿考试喽。。。。
+1/61
-
深圳大学柔性电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/48
-
香港科技大学计算物理及流体力学课题组招收全奖博士后及博士生（2026年9月入学）
+1/44
-
科罗拉多大学 Congjun Yu 课题组招聘
+1/29
-
武汉工程大学绿碳技术与智能材料课题组诚招2026年博士研究生
+2/20
-
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
+1/13
-
四川大学华西医院沈百荣教授课题组科研助理招聘启事
+1/8
-
上海理工大学顾敏院士、张轶楠教授团队 招聘 2026级 光学工程 博士生
+1/6
-
山东第一医科大学第一附属医院招聘事业编制科研岗
+1/5
-
广东省智能院与澳门大学/澳门理工联培博士招生
+1/4
-
华南理工大学宋波教授联合唐本忠院士招聘化学和材料方向博士后（长期有效）
+1/2
-
上海理工大学“新能源材料”专业-赵斌教授招收申请考核制博士生【能源催化方向】
+1/2
-
电子科技大学，电子科学与工程学院，杨青慧教授，2026年博士研究生招生
+1/2
-
海南大学国家优青团队招聘“AI/大数据+材料”方向专任教师（事业编制）
+1/1
-
中科大国家级青年人才招聘（无机非金属材料、化学等方向）博士
+1/1
zhj10.26(金币+5): 2010-11-23 15:16:16
|
这是Amber程序不识别小分子信息的一部分，可在Gauss中用POP=MK拟合静电势得到，具体可参考下Amber教程。 下面是核酸小分子供你参考： http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial1/section1.htm |
2楼2010-11-23 12:17:05