应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】autodock4.2对接时，柔性残基的选择
21/1返回列表
查看: 664  |  回复: 1
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我芹菜

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】autodock4.2对接时，柔性残基的选择

本人使用的是AUTODOCK4.2版本，在对接的时候，要选择柔性残基，不知道选择什么样的，。另，在验证试验中RMSD值在多少以内比较好，如何通过RMSD值来确定验证试验的结果是否好，请教各位，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-11-23 09:01:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
我芹菜(金币+1): 2010-12-10 08:56:14
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-12-10 10:47:32
首先，你去看看Autodock的教程，会有很详细的教你怎么做柔性对接的。

其次，如果配体小分子刚性好，那么rmsd一般要求小于1.5，如果小分子柔性大，一般要求小于2.5

这只是验证Autodck是否可以重现晶体结构中的结合模式而已，其他方面谨慎考虑.
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-12-10 01:05:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 我芹菜 的主题更新
21/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭