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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】gaussian 重复文献工作
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian 重复文献工作 已有3人参与

gaussian 对文献中物质进行重复工作：采用相同的机组和理论进行opt Freq 计算出来的几何优化结构和频率均不一样 是不是文献中有未提到的优化过程？？
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1楼 2010-11-23 08:06:26
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)
★
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有可能是引入了修正，或者不同的条件等等。也可能是软件版本不同 或者是 有一些失误 可能是你 可能是他 所以才有comment
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2楼2010-11-23 11:57:17
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)
文献中提到：

“理论模拟统一采用Gaussian03软件包中的DFT/B3LYP/6-31G(d)方法。都是首
先对各个单分子构型精确的进行优化，然后在几何优化好的结构上，应用相同的
方法和基组对对它们的红外振动频率进行模拟计算。”

我的重复性工作：利用chem3D直接生成gjf， 利用高斯03 进行opt+freq 结果不一样，不知道大家是否遇到过？  是否需要gaussview来生成gjf？？

谢谢大家了！！
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3楼2010-11-25 08:27:10
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
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差别大么？ 你可以试试用他计算的结构来重复一下。
如果差别很大的话，可能你给的初始模型不准
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惺惺相惜情不自禁
4楼2010-11-25 08:45:27
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)
就是不太懂初始模型是怎么弄的，我是直接chemcd画出 3d生成gjf了  不知道这样对不对？
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5楼2010-11-25 08:58:03
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
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引用回帖:
Originally posted by guohui_Hao at 2010-11-25 08:58:03:
就是不太懂初始模型是怎么弄的，我是直接chemcd画出 3d生成gjf了  不知道这样对不对？

。。。。。。不建议 模型越复杂越不对
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惺惺相惜情不自禁
6楼2010-11-25 09:05:59
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)
可否Q聊下 254281974
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7楼2010-11-25 09:17:50
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)
文献中一般都采用DFT进行分子建模和优化，不知道无晶体结构的物质还能采用什么好的方法优化？
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8楼2010-11-25 11:08:01
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
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引用回帖:
Originally posted by guohui_Hao at 2010-11-25 11:08:01:
文献中一般都采用DFT进行分子建模和优化，不知道无晶体结构的物质还能采用什么好的方法优化？

DFT目前来说是比较合适的。
但是你的问题在于初始结构，不在于你用什么方法。查阅文献或者相关文献找到类似结构给出合理初始猜想再做优化吧。
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惺惺相惜情不自禁
9楼2010-11-25 11:44:48
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guohui_Hao

银虫 (小有名气)
我懂了 谢谢你了！！
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10楼2010-11-25 15:21:34
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