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erghper

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助成功】求ubuntu中vasp程序安装最后一步出错!!郁闷!!! 已有5人参与

我在安转vasp时,最后一步vasp.5.2的makefile.linux_ifc_p4文件出错,改了很多次,没办法,想找找论坛上的高手帮帮忙!!!!


/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Comm_group'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Group_incl'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Wtime'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Group_free'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Rsend'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `mkl_serv_deallocate'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Testall'
/opt/intel/mkl/lib/ia32/libmkl_blacs_intelmpi.so: undefined reference to `MPI_Type_struct'
make: *** [vasp] 错误 1
usr:~$
我的/opt/intel/mkl/lib/ia32下文件内容是
usr:/opt/intel/mkl/lib/ia32$ ls
libmkl_avx.so                        libmkl_cdft_core.a              libmkl_gf.so                       libmkl_intel_thread.so  libmkl_pgi_thread.a             libmkl_sequential.so             libmkl_vml_p4m2.so
libmkl_blacs.a                     libmkl_cdft_core.so               libmkl_gnu_thread.a               libmkl_lapack95.a       libmkl_pgi_thread.so           libmkl_solver.a                      libmkl_vml_p4m3.so
libmkl_blacs_intelmpi.a         libmkl_core.a                     libmkl_gnu_thread.so                libmkl_p4m3.so          libmkl_rt.so                           libmkl_solver_sequential.a                        libmkl_vml_p4m.so
libmkl_blacs_intelmpi.so       libmkl_core.so                     libmkl_intel.a                       libmkl_p4m.so           libmkl_scalapack_core.a      libmkl_vml_avx.so                          libmkl_vml_p4p.so
libmkl_blacs_openmpi.a             libmkl_def.so                     libmkl_intel.so                       libmkl_p4p.so           libmkl_scalapack_core.so          libmkl_vml_def.so                   libmkl_vml_p4.so
libmkl_blas95.a                      libmkl_gf.a                         libmkl_intel_thread.a                 libmkl_p4.so            libmkl_sequential.a                     libmkl_vml_ia.so            locale
usr:/opt/intel/mkl/lib/ia32$

[ Last edited by erghper on 2010-11-24 at 08:03 ]
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erghper

铜虫 (小有名气)

注 :我的makefile.linux_ifc_p4文件类容如下;
。。。。。
107 # ifc.9.1, ifc.10.1 recommended
108 OFLAG=-O3
109
110 OFLAG_HIGH = $(OFLAG)
111 OBJ_HIGH =
112 OBJ_NOOPT =
113 DEBUG  = -FR -O0
114 INLINE = $(OFLAG)
115
116 #-----------------------------------------------------------------------
117 # the following lines specify the position of BLAS  and LAPACK
118 # VASP works fastest with the libgoto library
119 # so that's what we recommend
120 #-----------------------------------------------------------------------
121
122 # mkl.10.0
123 # set -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines
124 #BLAS=-L/opt/intel/mkl100/lib/em64t -lmkl -lpthread
125
126 # even faster for VASP Kazushige Goto's BLAS
127 # http://www.cs.utexas.edu/users/kgoto/signup_first.html
128 # parallel goto version requires sometimes -libverbs
129 #BLAS=  /opt/intel/libgoto/libgoto.so
130 BLAS= /opt/intel/mkl/lib/ia32 -lmkl_intel -lgnu -lpthread
131 # LAPACK, simplest use vasp.5.lib/lapack_double
132 LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o
133
134 # use the mkl Intel lapack
135 #LAPACK= -lmkl_lapack
136
137 #-----------------------------------------------------------------------
138
139 LIB  = -L../vasp.5.lib -ldmy \
140      ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \
141      $(BLAS)
142
143 # options for linking, nothing is required (usually)
144 LINK    =
145
146 #-----------------------------------------------------------------------
147 # fft libraries:
。。。。。。。。。。。。。。

[ Last edited by erghper on 2010-11-18 at 21:45 ]
2楼2010-11-18 21:34:45
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-11-18 22:01:26
引用回帖:
Originally posted by erghper at 2010-11-18 21:34:45:
注 :我的makefile.linux_ifc_p4文件类容如下;
.SUFFIXES: .inc .f .f91 .F
#-----------------------------------------------------------------------
# Makefile for Intel Fortran compiler for Pentiu ...

你安装的是并行版的吧?应该是你的mpi没装好
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2010-11-18 21:46:12
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erghper

铜虫 (小有名气)

我的mpi安好 了阿

usr:~$ which mpicc
/usr/local/bin/mpicc
usr:~$ which mpic++
/usr/local/bin/mpic++
应该没有问题阿
4楼2010-11-18 21:49:32
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by erghper at 2010-11-18 21:49:32:
我的mpi安好 了阿

usr:~$ which mpicc
/usr/local/bin/mpicc
usr:~$ which mpic++
/usr/local/bin/mpic++
应该没有问题阿

你安装的是什么mpi?intelmpi吗?如果不是从错误提示上来看,那应该你的库设置错了
嘟啦啦嘟啦啦嘟
5楼2010-11-19 09:40:58
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huangguiyang

新虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-11-19 12:20:09
你可以在网上找到合适的makefile.
6楼2010-11-19 10:59:30
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erghper

铜虫 (小有名气)


我自己下的 mpich2-1.3.1rc1.tar.gz
自己也在网上找了很多相关的,都没改对 阿,真不知道到底啥问题,都快郁闷死了!!!
7楼2010-11-19 11:49:10
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erghper

铜虫 (小有名气)

我自己下的 mpich2-1.3.1rc1.tar.gz
自己也在网上找了很多相关的,都没改对 阿,真不知道到底啥问题,都快郁闷死了!!!
8楼2010-11-19 11:50:09
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mazuju028

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-11-19 12:27:39
有没有试一下mpich2安装包下的example,可是看出是不是mpi的问题。
锐气藏于胸,和气浮于脸,才气见于事,义气施与人
9楼2010-11-19 12:21:56
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-11-19 15:07:26
试试用gotoblas2,我前一段编译4.6的时候,也是一直过不去。后来,我用gotoblas2以及vasp自带的LAPACK_double.o就编译过去了!
差不多在第136行左右的BLAS改成GotoBLAS2下的libgoto.so的路径,LAPACK路径默认就可以了。
10楼2010-11-19 13:12:44
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