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Hansongtao

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[交流] 【求助】如何读取输出文件中的键级

我计算了葡萄糖的键级，其中相关部分的输出文件如下所示：
Wiberg bond index matrix in the NAO basis:                                    

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1.  C  0.0000  0.9717  0.0062  0.0030  0.0118  0.9027  0.0031  0.0176  0.0019
   2.  C  0.9717  0.0000  0.9653  0.0083  0.0029  0.0281  0.8916  0.9360  0.0003
   3.  C  0.0062  0.9653  0.0000  0.9684  0.0079  0.0047  0.0014  0.0347  0.0008
   4.  C  0.0030  0.0083  0.9684  0.0000  0.9615  0.0270  0.0107  0.0020  0.0027
   5.  C  0.0118  0.0029  0.0079  0.9615  0.0000  0.9012  0.0003  0.0005  0.8658
   6.  O  0.9027  0.0281  0.0047  0.0270  0.9012  0.0000  0.0116  0.0027  0.0264
   7.  H  0.0031  0.8916  0.0014  0.0107  0.0003  0.0116  0.0000  0.0281  0.0000
   8.  O  0.0176  0.9360  0.0347  0.0020  0.0005  0.0027  0.0281  0.0000  0.0001
   9.  H  0.0019  0.0003  0.0008  0.0027  0.8658  0.0264  0.0000  0.0001  0.0000
   Wiberg bond index, Totals by atom:                                            

     Atom    1
     ---- ------
   1.  C  3.8471
   2.  C  3.8674
   3.  C  3.8475
   4.  C  3.8805
   5.  C  3.7877
   6.  O  2.0193
   7.  H  0.9533
   8.  O  1.8029
   9.  H  0.9734
  10.  O  1.7920
  11.  H  0.9605
  12.  O  1.7896
  13.  H  0.9532
  14.  O  1.7966
  15.  H  0.9287
  16.  C  3.8038
  17.  O  1.7841
  18.  H  0.7638
  19.  H  0.7567
  20.  H  0.7554
  21.  H  0.7573
  22.  H  0.9674
  23.  H  0.9416
  24.  H  0.7817


Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:                                    

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1.  C  0.0000  0.8444  0.0051 -0.0130  0.0235  0.7375  0.0074 -0.0167 -0.0135
   2.  C  0.8444  0.0000  0.8396 -0.0019 -0.0164 -0.0235  0.7568  0.7665 -0.0009
   3.  C  0.0051  0.8396  0.0000  0.8367  0.0162 -0.0078 -0.0021 -0.0093 -0.0057
   4.  C -0.0130 -0.0019  0.8367  0.0000  0.8530 -0.0219  0.0061  0.0001  0.0028
   5.  C  0.0235 -0.0164  0.0162  0.8530  0.0000  0.7563  0.0003  0.0003  0.7667
   6.  O  0.7375 -0.0235 -0.0078 -0.0219  0.7563  0.0000  0.0030  0.0016 -0.0231
   7.  H  0.0074  0.7568 -0.0021  0.0061  0.0003  0.0030  0.0000 -0.0203  0.0000
   8.  O -0.0167  0.7665 -0.0093  0.0001  0.0003  0.0016 -0.0203  0.0000  0.0000
   9.  H -0.0135 -0.0009 -0.0057  0.0028  0.7667 -0.0231  0.0000  0.0000  0.0000
   Atom-atom overlap-weighted NAO bond order, Totals by atom:                    

     Atom    1
     ---- ------
   1.  C  3.2031
   2.  C  3.1757
   3.  C  3.1716
   4.  C  3.1520
   5.  C  3.1628
   6.  O  1.3693
   7.  H  0.7391
   8.  O  1.3335
   9.  H  0.8178
  10.  O  1.3545
  11.  H  0.7459
  12.  O  1.3280
  13.  H  0.7402
  14.  O  1.3480
  15.  H  0.7623
  16.  C  3.0926
  17.  O  1.3062
  18.  H  0.6143
  19.  H  0.6108
  20.  H  0.6125
  21.  H  0.6132
  22.  H  0.8179
  23.  H  0.8015
  24.  H  0.6105


MO bond order:                                                               

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1.  C  0.0000  0.6904 -0.1161  0.0077 -0.1987 -0.6216 -0.0783 -0.0183 -0.0100
   2.  C  0.6904  0.0000 -1.2356 -0.1024 -0.0625 -0.0696 -0.5006  0.5577 -0.0040
   3.  C -0.1161 -1.2356  0.0000 -0.5632 -0.1631  0.0046 -0.0374 -0.0345 -0.0114
   4.  C  0.0077 -0.1024 -0.5632  0.0000  0.8218  0.0550 -0.0190  0.0487 -0.0108
   5.  C -0.1987 -0.0625 -0.1631  0.8218  0.0000 -1.2915  0.0055  0.0652  0.6267
   6.  O -0.6216 -0.0696  0.0046  0.0550 -1.2915  0.0000 -0.0397  0.0394 -0.0140
   7.  H -0.0783 -0.5006 -0.0374 -0.0190  0.0055 -0.0397  0.0000  0.1958 -0.0001
   8.  O -0.0183  0.5577 -0.0345  0.0487  0.0652  0.0394  0.1958  0.0000  0.0101
   9.  H -0.0100 -0.0040 -0.0114 -0.0108  0.6267 -0.0140 -0.0001  0.0101  0.0000
   MO atomic valencies:                                                         

     Atom    1
     ---- ------
   1.  C -0.3667
   2.  C -0.2960
   3.  C -0.7154
   4.  C  2.4239
   5.  C -0.6228
   6.  O -1.5804
   7.  H -0.5259
   8.  O  1.2181
   9.  H  1.0336
  10.  O  0.4048
  11.  H  2.0692
  12.  O  2.0280
  13.  H  0.5370
  14.  O  2.3698
  15.  H -0.7852
  16.  C  1.6176
  17.  O -0.1466
  18.  H  0.3665
  19.  H  0.5530
  20.  H  1.4933
  21.  H  1.6378
  22.  H  1.8044
  23.  H  0.6395
  24.  H  0.8442

我的问题是:
1.如何读取这些键级参数,就是说哪些数据对应相应的键级。特别是wiberg bond order，因为我看其他人帖子说wiberg键级和一般意义的键级最接近。
2。其次是Atom-atom overlap-weighted NAO bond order和MO bond order 该如何读取？
多谢了！

葡萄糖结输出结构如下：
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1楼 2010-11-18 09:42:33
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quantumor

金虫 (著名写手)
★
Hansongtao(金币+1):谢谢参与
键级不是实验可观测物理量，这类似于电荷分布的情形。所以当使用不同的理论观点进行分析时，所得出的结果是有差异的，有时甚至是很大的差异。一般地，大家通常更愿意使用计算结果比较接近于宏观概念上的单键、双键、三键的键级分别为1、2、3的理论结果，所以，通常个人使用“Wiberg bond index”作为键级进行讨论。
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3楼2010-11-21 15:52:32
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