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360661738

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】无法用高斯软件算出含吡啶、呋喃这类分子的能级轨道

无法用高斯软件算出含吡啶、呋喃这类分子的能级轨道。是不是软件的问题啊?请高手指点迷津。小妹我不胜感激!
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sunhaitao

木虫 (小有名气)


具体怎么不能算了?
2楼2010-11-16 13:21:55
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360661738

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by sunhaitao at 2010-11-16 13:21:55:
具体怎么不能算了?


点击确定之后就出现:

请问是什么问题啊?
3楼2010-11-16 13:33:07
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sunhaitao

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 360661738 at 2010-11-16 13:33:07:


点击确定之后就出现:

请问是什么问题啊?

你在开始输入行,加上%mem=800mb看看
4楼2010-11-16 13:49:44
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ykwang

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by 360661738 at 2010-11-16 13:33:07:
点击确定之后就出现:
请问是什么问题啊?

明显是内存不够。你计算的好在是些小分子,置%mem=50MW足够了。
5楼2010-11-16 15:39:23
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)


内存不够 指定多了,不需要的
6楼2010-11-16 15:53:39
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360661738

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by sunhaitao at 2010-11-16 13:49:44:

你在开始输入行,加上%mem=800mb看看

我电脑的内存为2GB啊。。我用chem3D优化后导出*gjc文件,转换为gjf文件后,发现含有呋喃吡啶这类的用高斯view打不开。显示
以下为gjf里面的内容

%chk= (BFu)2Bt.chk
%mem= 50MB
# opt b3lyp/6-31g freq

(BFu)2Bt

  0  1
C 0    0.046103   -1.416489    0.070903
C 0    0.013762   -2.765328    0.079870
C 0    1.273809   -0.592725    0.161596
C 0    1.272388   -3.563606    0.015531
C 0   -1.281285   -3.489842    0.036770
C 0    2.316628   -0.905061    1.041221
C 0    3.481924   -0.133081    1.067296
C 0    3.619132    0.984713    0.237629
C 0    2.548950    1.329159   -0.599997
C 0    1.381563    0.566297   -0.617755
C 0   -2.420647   -2.998031    0.688501
C 0   -3.632659   -3.693388    0.647619
C 0   -3.750206   -4.902983   -0.048456
C 0   -2.608832   -5.395315   -0.699043
C 0   -1.397091   -4.704087   -0.653917
C 0    1.474891   -4.639636    0.888173
C 0    2.668857   -5.361446    0.860856
C 0    3.692477   -5.018150   -0.033172
C 0    3.474961   -3.968393   -0.930298
C 0    2.269961   -3.260682   -0.917843
C 0   -5.024019   -5.661109   -0.064795
C 0    4.975991   -5.762608   -0.039518
C 0    4.894202    1.747256    0.204690
C 0   -6.280331   -5.024881   -0.120700
C 0   -7.467214   -5.764363   -0.080881
C 0   -7.473520   -7.162591   -0.007683
C 0   -6.238169   -7.797543    0.025274
C 0   -5.039146   -7.057403    0.001288
C 0    5.009814   -7.159006   -0.014504
C 0    6.223012   -7.873413   -0.025097
C 0    7.446878   -7.212255   -0.047966
C 0    7.416475   -5.812753   -0.059438
C 0    6.213682   -5.096335   -0.061865
O 0   -6.544690   -3.668856   -0.197566
C 0   -7.920681   -3.549653   -0.185702
C 0   -8.545153   -4.796572   -0.115991
C 0    8.471738   -4.819823   -0.055524
C 0    7.819338   -3.583282   -0.051320
O 0    6.447345   -3.734404   -0.061286
C 0   -8.680987   -2.371073   -0.207250
C 0  -10.066381   -2.491182   -0.168322
C 0  -10.690639   -3.754905   -0.106600
C 0   -9.940391   -4.925269   -0.079524
C 0    9.869268   -4.918201   -0.043362
C 0   10.594412   -3.730252   -0.029475
C 0    9.943450   -2.480634   -0.029391
C 0    8.554168   -2.390389   -0.041744
C 0    6.093965    1.053275    0.069124
C 0    7.326105    1.725452   -0.049623
C 0    7.379770    3.110918   -0.047169
C 0    6.180386    3.834657    0.098740
C 0    4.956845    3.159713    0.227845
C 0    6.024503    5.273812    0.105742
C 0    4.687106    5.651703    0.273486
S 0    3.639938    4.279105    0.440791
C 0    7.017490    6.261760   -0.049782
C 0    6.643262    7.598295   -0.034245
C 0    5.293968    7.971256    0.135851
C 0    4.308028    7.007543    0.291062
H 0   -0.897110   -0.860004   -0.072362
H 0    2.238150   -1.767153    1.722364
H 0    4.295962   -0.421268    1.752293
H 0    2.634624    2.178491   -1.295751
H 0    0.566690    0.848801   -1.304530
H 0   -2.372334   -2.069868    1.280070
H 0   -4.486909   -3.288135    1.213017
H 0   -2.653016   -6.335629   -1.271722
H 0   -0.531243   -5.126523   -1.189946
H 0    0.701571   -4.905153    1.627574
H 0    2.812603   -6.183791    1.579950
H 0    4.244880   -3.700988   -1.672131
H 0    2.119308   -2.454872   -1.654419
H 0   -8.416049   -7.729350    0.031393
H 0   -6.197167   -8.896911    0.094462
H 0   -4.093016   -7.618448    0.071950
H 0    4.066252   -7.729073   -0.004679
H 0    6.204168   -8.975541   -0.015216
H 0    8.400433   -7.761630   -0.049774
H 0   -8.190015   -1.386547   -0.247624
H 0  -10.689904   -1.581946   -0.179132
H 0  -11.790725   -3.814875   -0.070749
H 0  -10.419160   -5.914514   -0.021287
H 0   10.370376   -5.897949   -0.039615
H 0   11.696145   -3.767746   -0.015781
H 0   10.545586   -1.556841   -0.016582
H 0    8.044418   -1.417067   -0.039375
H 0    6.088451   -0.047360    0.012267
H 0    8.255307    1.145232   -0.173619
H 0    8.345934    3.625025   -0.163772
H 0    8.074016    5.988190   -0.192066
H 0    7.410178    8.379954   -0.162090
H 0    5.019549    9.038870    0.141304
H 0    3.253641    7.297951    0.420287
Lp 0   -6.190625   -3.286604   -0.500285
Lp 0    6.052856   -3.314969    0.112022

用chem3D优化的过程中氧原子上好像多出了两个小小的点。不知道啥东西。。请高手指点迷津!!!
7楼2010-11-16 23:23:29
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fooo

金虫 (正式写手)


360661738(金币+5):删去LP那两行就能算。。谢谢啦!不过我不知道在哪里指定“电荷与多重度”哦。。能不能交下我 啊? 2010-11-17 19:49:14
你的坐标有问题,把元素符号后面的了“0”都删除试试。另外,最后两行是什么元素?gaussview不认识的,如果是孤电子,在电荷与多重度那里指定好了,这两行似乎也应该删除。
引用回帖:
Originally posted by 360661738 at 2010-11-16 23:23:29:

我电脑的内存为2GB啊。。我用chem3D优化后导出*gjc文件,转换为gjf文件后,发现含有呋喃吡啶这类的用高斯view打不开。显示
以下为gjf里面的内容
...

8楼2010-11-17 03:12:06
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sunhaitao

木虫 (小有名气)


360661738(金币+5):LP那几行直接删去就可以了吗?不用改其它的吧? 多谢指点! 2010-11-17 19:51:30
Lp的 那两行是孤对电子,需要删去!不然会出错
9楼2010-11-17 09:08:50
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sunhaitao

木虫 (小有名气)


一般用内坐标形式就不会出现 Lp,笛卡尔坐标用于多环类,内坐标多用于长链类,不过区别不大的
10楼2010-11-17 09:12:37
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fooo

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
电荷与多重度就是上面的“0 1”,其实你已经指定了,只不过不知道对不对。
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-11-17 03:12:06:
你的坐标有问题,把元素符号后面的了“0”都删除试试。另外,最后两行是什么元素?gaussview不认识的,如果是孤电子,在电荷与多重度那里指定好了,这两行似乎也应该删除。


11楼2010-11-18 00:50:31
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