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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【问题反馈】怎么用quantity one软件处理DGGE图谱香农指数和均匀度
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cuihj

新虫 (初入文坛)

[交流] 【问题反馈】怎么用quantity one软件处理DGGE图谱香农指数和均匀度 已有5人参与

求助：用Quantity one 作DGGE示意图谱时，怎样用他计算shannon-weaver指数
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1楼 2010-11-12 09:30:59
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天鸟

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我是在"reports"中的"all lanes report"有个选项是peak density，然后输出来后就是每个条带都有个数值，我根据每个条带的数值除于该泳道总的peak density值，根据那些数值放到一个软件中，该软件就会计算出SHANNON INDEX。这其实是我的理解，你也可以自己想想怎么做吧
嘿嘿
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快乐生活，我快乐
8楼2011-09-27 16:32:58
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孙盛楠

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by cuihj at 2010-11-12 09:30:59:
求助：用Quantity one 作DGGE示意图谱时，怎样用他计算shannon-weaver指数

您好！你知道怎么用这个软件计算多样性指数了吗？盼回复，谢谢！
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2楼2011-03-07 15:22:06
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laidyar

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by cuihj at 2010-11-12 09:30:59:
求助：用Quantity one 作DGGE示意图谱时，怎样用他计算shannon-weaver指数

你现在知道了么  求帮助
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3楼2011-09-20 10:14:17
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天鸟

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+3): good 2011-09-22 08:06:47
我是觉得只通过quantity one是不能计算出多样性指数来吧
还需要将它用另外的软件来计算的吧
一般都是将条带的亮度转换成数字，再通过这些数字通过另外一个软件来计算多样性的。我也是自己刚接触的理解，还希望有用过的指点
赞一下(2人) 回复此楼
快乐生活，我快乐
4楼2011-09-21 22:09:17
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