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quantum999

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[交流] 【求助】NWCHEM6.0编译出错已有2人参与

在集群上，NWCHEM6.0编译出错如下

/usr/bin/ld: cannot find -lnwctask
child process exit status 1: /usr/bin/ld
make: *** [all] Error 2

那位朋友帮忙解决一下，期待中

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1楼 2010-11-05 15:21:51

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quantum999

金虫 (著名写手)

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环境变量中只添加了pgi
PGI=/public1/software/pgi
export PGI
MANPATH=$MANPATH:$PGI/linux86-64/7.1/man
export MANPATH
LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat
export LM_LICENSE_FILE
PATH=$PGI/linux86-64/7.1/bin:$PATH
export PATH

编译脚本如下
export LARGE_FILES=TRUE
export NWCHEM_TOP=/home/users/XXXX/soft/nwchem-6.0
export NWCHEM_TARGET=LINUX64
export NWCHEM_TARGET_CPU=x86_64
#export NWCHEM_TARGET_CPU=x86
export NWCHEM_MODULES=qm
export FC=pgf90
#export USE_INTEGER4=y
export OPTIMIZE=y

#export USE_MPI=y
#export MPI_LOC=/public1/software/pgi/linux86-64/7.1/mpi/mpich/
#export MPI_LIB=$MPI_LOC/lib
#export MPI_INCLUDE=$MPI_LOC/include
#export LIBMPI="-lmpich -lpthread"
#export LIBMPI="-lmpich"
#export ARMCI_NETWORK=VIA

cd $NWCHEM_TOP/src
make nwchem_config
make FC=pgf90 CC=gcc > make.log

报错如下
gcc: unrecognized option '-Mnomain'
../../lib/LINUX64/libtcgmsg.a(cluster.o): In function `InitGlobal':
cluster.c

.text+0x467): undefined reference to `__c_mzero8'
../../lib/LINUX64/libtcgmsg.a(sema.o): In function `InitSemSetList':
sema.c

.text+0x16): undefined reference to `__c_mset4'
collect2: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [test.x] Error 1
make[2]: *** [test.x] Error 2
make[1]: *** [tools] Error 2
make: *** [libraries] Error 1

make。log如下
test -d /home/users/xxxxx/soft/nwchem-6.0/lib/LINUX64_x86_64 || mkdir -p /home/users/xxxxx/soft/nwchem-6.0/lib/LINUX64_x86_64
Making libraries in tools
test -d /home/users/xxxxx/soft/nwchem-6.0/bin/LINUX64_x86_64 || mkdir -p /home/users/xxxxx/soft/nwchem-6.0/bin/LINUX64_x86_64

*** Building Parallel Tools ****

>>> making Memory Allocator (MA) library <<<
(cd ./ma; make CC=gcc FC=pgf90)
echo ../lib/LINUX64/libma.a
../lib/LINUX64/libma.a
>>> making TCGMSG library <<<
(cd ./tcgmsg; make CC=gcc FC=pgf90 MACHINE=LINUX64)
(cd ipcv4.0; make test.x)
echo ../../lib/LINUX64/libtcgmsg.a
../../lib/LINUX64/libtcgmsg.a
gcc -DLINUX64 -DLINUX -DEXT_INT -DPGLINUX -DNOUSE_MMAP -DTIMINGS -DNOSPIN -DSYSV -DSHMEM -O2 -funroll-loops -Mnomain -o test.x test.c ../../li
b/LINUX64/libtcgmsg.a

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7楼2010-11-07 11:12:52

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pwzhou

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★
quantum999(金币+1):谢谢参与
quantum999(金币+1): 2010-11-05 23:34:14

给点详细的信息啊，什么操作系统？什么编译器？你是按照怎样的步骤安装的，这一步是在什么地方出错的？

引用回帖:

Originally posted by quantum999 at 2010-11-05 15:21:51:
在集群上，NWCHEM6.0编译出错如下

/usr/bin/ld: cannot find -lnwctask
child process exit status 1: /usr/bin/ld
make: *** [all] Error 2

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2楼2010-11-05 16:26:34

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