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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】CuBTC MOF + CO2 MuSiC 问题
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ldf831206

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看帖时看到楼主现在把注意力集中于氨气在MOFs中的吸附了，不知道进展的如何呢？我也想研究这个。但是还是菜虫行列。。现在会用MUSIC做CO2、甲烷等气体在MOFs上的吸附。
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91楼2011-01-04 11:27:36
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-06 22:49:32
引用回帖:
Originally posted by ldf831206 at 2011-01-04 11:27:36:
看帖时看到楼主现在把注意力集中于氨气在MOFs中的吸附了，不知道进展的如何呢？我也想研究这个。但是还是菜虫行列。。现在会用MUSIC做CO2、甲烷等气体在MOFs上的吸附。

掌握这些了，已经不是菜鸟了，NH3模拟只是因为NH3没有一个公认合适的模型，而在music计算方面并无特别的困难。
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92楼2011-01-04 19:24:56
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ldf831206

新虫 (小有名气)
超大人真实无处不在啊
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93楼2011-01-05 09:18:22
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ldf831206

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ldf831206 at 2011-01-05 09:18:22:
超大人真的是无处不在啊

94楼2011-01-05 09:18:53
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qphll

金虫 (正式写手)
多谢版主帮忙回复, 才过完年就跑出去了. 没有时间来做更新和答复, 大家多多包涵.
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Life, Love, Laugh.
95楼2011-01-05 11:11:37
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ldf831206

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我想问 你一个问题  你的emap的 atom-atom文件里面的probe原子中的 patom与骨架之间的 作用力是什么啊？都不见你写的？

也就是emap的   原子-原子文件能贴出来吗？？谢谢

[ Last edited by ldf831206 on 2011-1-5 at 20:38 ]
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96楼2011-01-05 20:33:08
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by qphll at 2010-11-03 14:13:26:
在用MuSiC测试体系: CO2+CuBTC的时候, 发现了两个问题:
(1) 采用与文献相同模拟, 相同参数, 相同软件的情况下, 吸附量差别很大;
(2) 改变压力做吸附等温线, 不同压力下的吸附量竟然差别不大.

应该是哪里的设 ...

我用自己编译的map.exe运行你的文件，怎么会出现这样的错误呢？
root@zyj-laptop:~/Desktop/CUBTC/emap#  molecule.F90 :  637 WARNING: probe is not charge neutral (1.00)
ewald.F90:   187 WARNING: nkmax is hard coded to 50000
Total number of K vectors calculated:          366
Total number of atoms used for K vec:          624
Creating grid for CuBTC_M4-probe map interaction
All coordinates generated!
pairmodel.F90:         1916
potential parameters for ewald map will not be stored
pairmodel.F90:         1916
potential parameters for ewald map will not be stored
pairmodel.F90:         1916
potential parameters for ewald map will not be stored
pairmodel.F90:         1916
potential parameters for ewald map will not be stored
pairmodel.F90:         1916
potential parameters for ewald map will not be stored
pairmodel.F90:         1916
最后map不能正常终止，必须使用ctrl+C退出，并且会出现段错误。
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好好学习，天天向上。
97楼2011-01-10 21:11:59
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-10 21:11:59:

我用自己编译的map.exe运行你的文件，怎么会出现这样的错误呢？
root@zyj-laptop:~/Desktop/CUBTC/emap#  molecule.F90 :  637 WARNING: probe is not charge neutral (1.00)
ewald.F90:   187 WARNING: nkma ...

解决了，是自己缺少包的缘故，呵呵。
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好好学习，天天向上。
98楼2011-01-11 14:52:06
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liwl926

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
有一问题不解，为什么low cutoff要设置为那么小呢？
我的理解是吸附原子在选择位置时如果遇到吸附剂内由原子和他的距离小于low cutoff时，此步就结束，不必计算。也就是离得太近了，算了也是高能点。那么我们就可以认为，在不太高的压力下，选用1A或者0.5A就应该足够了。但你的测试说0.5A还远远不够，困惑了！
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99楼2011-01-17 16:33:54
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angela1888

新虫 (初入文坛)

强帖，必顶

学习了，谢谢
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100楼2011-01-19 16:12:16
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