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奔鲨

铁虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】各种泛函计算反应势垒,是否可以不考虑泛函对基态反应物分子几何优化的准确性 已有6人参与

现在的密度泛函方法忒多了,尤其是Truhlar大人,发明和创造了忒多的泛函
根据最近的文献阅读,发现BHandHLYP和BMK, KMLYP, M05-2X, M06-2X, MPWB1K等等比较受欢迎。
但是这些泛函在优化基态分子几何构型时却不太令人满意。
对过渡态优化,当然是利用各种不同的泛函。
对基态优化的话,是利用实验构型呢,还是利用泛函,就算泛函的结果很差
当然,一般反应要经历R-->IM1-->TS-->IM2-->P
R=Reactants
IM1=Pre-reactive complex
TS=transition state
IM2=Post-reactive complex
P=Products

最近用B3LYP,对某反应的IM1和TS比较,未经ZPE校正时,IM1能量尚低于TS,经过ZPE校正后,IM1则高于TS,B3LYP优化几何构型还行,算势垒一般都低估

[ Last edited by 奔鲨 on 2010-10-31 at 15:31 ]
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 奔鲨 at 2010-11-01 13:59:20:

谢谢提示。
刚才认真比较了一下过渡态和pre-reactive complex的自由能,发现后者比前者确实要高一些。
不过好像没见过比较自由能的文献呢。。
一般都是比较电子能量+ZPE或者焓,

而且,对络合物还没有做 ...

这个不对吧 研究机理的话现在都用自由能啊,反倒是用电子能的越来越被鄙视了
惺惺相惜情不自禁
6楼2010-11-01 14:48:42
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奔鲨

铁虫 (著名写手)

还有,如果泛函算分子构型都不准确,那是否说明,其算能量不准确?
而B3LYP算势垒也不准,但是算分子构型参数就是准,真实神奇啊
从头算QCISD(T)、CCSD(T),俺的机器不行啊
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
2楼2010-10-31 15:05:11
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ykwang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
尽管没有一种泛函是万能的,但对基态几何和反应势垒分别用不同的泛函计算是不可接受的,因为那是在“拟合”实验而不是“预测”反应路径!可接受的泛函
应该两者兼顾,不能只照顾一方。
Nothing_Is_Impossible!
3楼2010-10-31 15:48:35
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

用自由能表示呢?
惺惺相惜情不自禁
4楼2010-11-01 08:40:17
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