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gtolv8688

铜虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】如何对CCDC下载的晶体结构理论加氢已有1人参与

我是做MOF吸附的，从CCDC中下载了MOF-9的cif文件，导入到MS中发现没有加氢。我在小木虫上搜索了一下，好像用Xshell可以理论加氢，我下载了Xshell6.3.1并导入了cif文件，结果发现只显示一个原子，右键Show all atoms也不管用。我又重新从CCDC中导出了res文件，这次看到了一个很乱的结构，键连得乱七八糟的。右键选择加氢，结果加完更乱了。请教熟悉晶体解析的高手们我要怎么做才能正确地为我的结构加上氢啊？有没有加化学键的命令啊？

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1楼2010-10-29 16:34:48

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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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gtolv8688(金币+2):期待专家的进一步解答：} 2010-10-30 16:48:57

CIF没有问题。用其他绘图程序可以读。
我转化成.res文件，你读这个看看。

TITL QINZOC
CELL 0.0000  27.0558  16.7945  28.1386  90.0000 102.0860  90.0000
LATT 7
SYMM -X,Y,-Z+1/2
SFAC  C  N  O  S Tb
TB1 5 0.29991 0.23302 -0.04538 1.00000 0.00000
S1 4 0.41480 0.13270 -0.00140 1.00000 0.00000
S2 4 0.30460 0.10170 -0.14080 1.00000 0.00000
S3 4 0.27530 0.08720 0.20820 1.00000 0.00000
S4 4 0.07830 0.02980 -0.01970 1.00000 0.00000
S5 4 0.09420 0.68010 0.05360 1.00000 0.00000
S6 4 0.07100 0.95500 0.16230 1.00000 0.00000
S7 4 0.05800 0.90300 0.19700 1.00000 0.00000
S8 4 0.06250 0.51130 0.16810 1.00000 0.00000
S9 4 0.03600 0.50600 0.20700 1.00000 0.00000
S10 4 0.13470 -0.04190 -0.15440 1.00000 0.00000
S11  4 0.17500 -0.04900 -0.11700 1.00000 0.00000
S12  4 0.12800 0.62100 -0.11000 1.00000 0.00000
S13 4 0.08100 0.65030 -0.15980 1.00000 0.00000
S14 4 0.29230 0.28600 0.35050 1.00000 0.00000
S15  4 0.24210 0.27200 0.31540 1.00000 0.00000
O1 3 0.34020 0.24960 0.03580 1.00000 0.00000
O2 3 0.28380 0.23440 0.08420 1.00000 0.00000
O3 3 0.30050 0.37360 -0.04190 1.00000 0.00000
O4 3 0.24780 0.34760 0.00630 1.00000 0.00000
O5 3 0.38210 0.27670 -0.06530 1.00000 0.00000
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O8 3 0.27640 0.12700 -0.10260 1.00000 0.00000
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O11 3 0.07690 0.61200 0.01960 1.00000 0.00000
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O13 3 0.00800 0.51200 0.14500 1.00000 0.00000
O14 3 0.17710 -0.05600 -0.17890 1.00000 0.00000
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C5 1 0.44210 0.25010 0.20470 1.00000 0.00000
C6 1 0.45880 0.24980 0.16060 1.00000 0.00000
C7 1 0.41880 0.24850 0.11780 1.00000 0.00000
C8 1 0.27090 0.39700 -0.01640 1.00000 0.00000
C9 1 0.25950 0.48400 -0.01240 1.00000 0.00000
C10 1 0.22390 0.50590 0.01390 1.00000 0.00000
C11 1 0.21550 0.59000 0.01860 1.00000 0.00000
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C17 1 0.45080 0.31000 -0.12330 1.00000 0.00000
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C39  1 0.11000 0.59500 -0.18100 1.00000 0.00000
C40 1 0.11500 0.55400 -0.15300 1.00000 0.00000
C41 1 0.24300 0.22600 0.36400 1.00000 0.00000
C42  1 0.28500 0.22200 0.30100 1.00000 0.00000
C43 1 0.32800 0.23500 0.31700 1.00000 0.00000
C44  1 0.35200 0.36600 0.39100 1.00000 0.00000
END