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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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飘在海上的雪

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】测序 已有11人参与

我做的是RNA反转录后的PCR产物测序，正向测序，反向测序什么差异，得到的序列是正向还是反向？
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不在沉默中爆发，就在沉默着死亡！
1楼 2010-10-26 20:00:27
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zhenpengchen

金虫 (小有名气)
★
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建议双向测序

去掉头尾后自己拼接（软件好像clustal X就可以，不太记得了，04年做的实验）

还有看色谱峰，自己优化序列

可以的话还要去基因库做blast

[ Last edited by zhenpengchen on 2010-10-27 at 15:36 ]
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14楼2010-10-27 15:34:41
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mazhenning

新虫 (初入文坛)
双向测序可以提高测序的准确度。厂家应该给你的是双向的两个序列。
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2楼2010-10-26 20:41:26
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飘在海上的雪

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by mazhenning at 2010-10-26 20:41:26:
双向测序可以提高测序的准确度。厂家应该给你的是双向的两个序列。

但是我测两段产物，正反两向只有96%，99%相似，是什么原因呢？

[ Last edited by 飘在海上的雪 on 2010-10-26 at 20:51 ]
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不在沉默中爆发，就在沉默着死亡！
3楼2010-10-26 20:46:06
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mazhenning

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 飘在海上的雪 at 2010-10-26 20:46:06:

但是正反两向只有96%相似，是什么原因呢？

是中间序列不匹配，还是两端的？
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4楼2010-10-26 20:48:29
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