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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】审稿人意见，不是很懂，大家帮帮忙！
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】审稿人意见，不是很懂，大家帮帮忙！


1.“I suggest that the authors include the clarifications for the basis set superposition error(BSSE) calculations in the manuscript.”  这句怎么理解？？

2.分子内的BSSE，怎么做，看了几篇文献，还是不会，望高手们指点。

[ Last edited by heyo_123 on 2010-10-27 at 15:05 ]
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1楼 2010-10-26 14:14:48
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ykwang

金虫 (正式写手)
heyo_123(金币+2):谢谢！！ 2010-10-28 09:27:38
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-10-27 15:07:47:
你说的没错，如果是AB体系就好办了。问题在于分子内氢键，本来这就是一个分子，硬要把它切割成A、B两个片段，切割处用补H，分子内氢键固定不动，我不明白的是AB两个片段中与分子内氢键无关的结构怎么办，要优化吗 ...

对于分子内氢键，既不需要切割，当然也不需要作BSSE校正。只需要把有氢键的构象与无氢键的构象在同一基组下进行比较就可以啦。
补充说明：对于同一个分子，如果无分子内氢键的构象不止一个，一定要选取其中能量最低的那一个进行比较。

[ Last edited by ykwang on 2010-10-27 at 16:48 ]
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Nothing_Is_Impossible!
13楼2010-10-27 16:04:38
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Joannaouc

木虫 (著名写手)
heyo_123(金币+1):谢了！ 2010-10-26 14:27:21
是不是软件里面有相关的选项啊？
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2楼2010-10-26 14:26:14
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
heyo_123(金币+5):能给几个例子吗？？我看了好多，就是不知道该怎么做！ 2010-10-26 14:48:31
分子内BSSE需要把分子在适当位置进行切割成为2个分子片段后再进行常规BSSE校正处理。注意要让涉及到分子内BSSE的区域仍然保持原来的相对位置不动，而通过调整构型让两个片段中的与BSSE不相关的区域尽量远离。切割点需要进行饱和处理（比如加氢）。
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3楼2010-10-26 14:42:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
heyo_123(金币+5):谢谢！！能给几个例子吗》？？？ 2010-10-26 14:49:12
楼主去查下Sławomir J. Grabowski这个人的文章，他做了好多分子内氢键的BSSE计算。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-10-26 14:45:42
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