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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】审稿人意见，不是很懂，大家帮帮忙！
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】审稿人意见，不是很懂，大家帮帮忙！


1.“I suggest that the authors include the clarifications for the basis set superposition error(BSSE) calculations in the manuscript.”  这句怎么理解？？

2.分子内的BSSE，怎么做，看了几篇文献，还是不会，望高手们指点。

[ Last edited by heyo_123 on 2010-10-27 at 15:05 ]
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1楼 2010-10-26 14:14:48
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fooo

金虫 (正式写手)
heyo_123(金币+3):谢谢！！ 2010-10-28 09:27:23
你说的没错，如果是AB体系就好办了。问题在于分子内氢键，本来这就是一个分子，硬要把它切割成A、B两个片段，切割处用补H，分子内氢键固定不动，我不明白的是AB两个片段中与分子内氢键无关的结构怎么办，要优化吗？如何理解把它们放远点？希望能有高人指点指点。多谢！
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-10-27 14:45:02:
3楼为正解。具体说来，计算某一AB体系的BSSE矫正的过程如下：
1. 用合适的基组分别优化并计算A、B和AB体系的能量E(A)、E(B)和E(AB)。
2. 再用计算AB的基组分别计算AB中的片段A和B的单点能量E‘(A)与E’(B)。
3 ...

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11楼2010-10-27 15:07:47
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Joannaouc

木虫 (著名写手)
heyo_123(金币+1):谢了！ 2010-10-26 14:27:21
是不是软件里面有相关的选项啊？
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2楼2010-10-26 14:26:14
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
heyo_123(金币+5):能给几个例子吗？？我看了好多，就是不知道该怎么做！ 2010-10-26 14:48:31
分子内BSSE需要把分子在适当位置进行切割成为2个分子片段后再进行常规BSSE校正处理。注意要让涉及到分子内BSSE的区域仍然保持原来的相对位置不动，而通过调整构型让两个片段中的与BSSE不相关的区域尽量远离。切割点需要进行饱和处理（比如加氢）。
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3楼2010-10-26 14:42:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
heyo_123(金币+5):谢谢！！能给几个例子吗》？？？ 2010-10-26 14:49:12
楼主去查下Sławomir J. Grabowski这个人的文章，他做了好多分子内氢键的BSSE计算。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-10-26 14:45:42
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