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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】mdrun 之后出现segmentation fault 怎么解决？
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jaychenyl

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】mdrun 之后出现segmentation fault 怎么解决？已有4人参与

请教各位高手：
能量最小化时，grompp 能够进行，但mdrun之后就会提示segmentation fault，这个问题一般要怎么解决，如果需要3个源文件，我再贴上。
先谢谢大家!!
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1楼2010-10-23 11:22:42
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jaychenyl

木虫 (小有名气)
自己顶起来~~
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2楼2010-10-24 10:41:21
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-24 19:28:22
我自己不用gromx，但有时也会碰到segmentation fault 错误。我的这种一般是力场文件或者坐标文件有问题，你好好检查每一个参数，试着修改一下。
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3楼2010-10-24 12:22:04
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jaychenyl

木虫 (小有名气)
我检查了一下 感觉坐标文件没什么问题啊 我把3个基本文件上传网盘了 麻烦大家帮我看一下 万分感谢  http://good.gd/782369.htm
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4楼2010-10-25 10:24:51
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jaychenyl

木虫 (小有名气)
再顶
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5楼2010-10-27 09:35:42
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-29 16:38:04
segment fault是内存非法访问的意思，可能你的程序编译有问题，也可能坐标文件有毛病

如果你用一些别的文件跑没有问题的话，那么就可能是坐标的问题
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技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
6楼2010-10-29 16:29:49
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-29 16:38:12
楼主你多试几次，我以前也遇到过这种错误，有时候多来几次mdrun就能跑。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
7楼2010-10-29 16:36:31
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