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baoyan

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】准确的建石墨烯结构的方法 已有18人参与

诚心向各位高手请教:在ms里怎么准确的建石墨烯的结构。
之前本人是在结构库里导出graphite的结构,通过buide-symmetry-make p1,剪掉一层结构,剩下的那一层就认为是石墨烯的结构了,之后就通过supercell的方式来增加原子个数。接着就进行结构优化,刚开始还能收敛,之后出现不收敛的情况。在考虑是不是结构出现了问题。

在网上找过一些资料,他们讲是这样见结构的:
(1)从MaterialsStudio 中graphite, 把层间距拉长。这样就能得到graphene.

(2) 先导入石墨(陶瓷文件里有),然后build---surface cleave,此时注意hkl的选取以及uv的方向的选取;然后点击确定即可。 加真空层的厚度,在BUILD--CRYSTAL 有vacumm选项,注意厚度的选择,一般大于15。 然后做超胞即可,superwell选项。

(3)导入graphite (in the  file of  structure-ceramics ), 然后build -Symmetry-make P1. 然后切掉中间一层。然后切掉其中一层,将剩下的一层移到c轴中间附近。
bulid-Symmetry-find symmetry-impose symmetry。 这样就得到了 honeycomb lattice primitive cell。
如果需要大片结构,可以用bulid - symmetry - Surpercell 来构建。。。得到菱形格子。
如果需要正交格子,将primitive cell 通过supercell  2*2 然后,然后留下立方格子的4个原子,其他切掉。重新构建晶格,build-rebuild 晶格参数,a=4.26, b=2.46 ,c=15。(通过几何换算得出,或者又构型量出) 角度全为90度。如果需要更大体系,同菱形,用supercell创建 。

请问在做石墨烯的高手,是怎么建石墨烯结构的。对于第二种方法是正确的话,hkl及uv要怎么选取?谢谢各位指教!
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水座

铁杆木虫 (小有名气)

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bingmou(金币+1):感谢参与 2010-10-19 21:16:25
你的方法和第三种是一样的。这几种应该都行。不收敛的问题应该不是结构的问题。
2楼2010-10-19 20:30:02
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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
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aylayl08(金币+1):感谢交流 2010-10-20 18:37:33
我也是这么做的,同样不能收敛,而且我优化石墨的结构都不能收敛,不知道为什么哦,望高手解决。
3楼2010-10-20 08:17:21
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.

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aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-10-20 18:37:21
基本原理,就是一层石墨,上下都有足够大的真空层

这几种方法都可以,不过我个人比较喜欢第二种切的
快乐科研,快乐生活。
4楼2010-10-20 09:29:26
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baoyan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2010-10-20 09:29:26:
基本原理,就是一层石墨,上下都有足够大的真空层

这几种方法都可以,不过我个人比较喜欢第二种切的

你好,那请问你用第二种方法切出来能收敛吗?你的h k l 和 u v 设为多少呢?谢谢你!
5楼2010-10-20 09:45:14
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.


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引用回帖:
Originally posted by baoyan at 2010-10-20 09:45:14:




你好,那请问你用第二种方法切出来能收敛吗?你的h k l 和 u v 设为多少呢?谢谢你!

hkl,uv是什么?
水平有限
快乐科研,快乐生活。
6楼2010-10-20 10:43:03
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.


zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-10-22 08:17:45
引用回帖:
Originally posted by baoyan at 2010-10-20 09:45:14:




你好,那请问你用第二种方法切出来能收敛吗?你的h k l 和 u v 设为多少呢?谢谢你!

单纯的石墨收敛没有问题,如果石墨烯上再吸附些过渡金属的情况,会有不收敛的现象
快乐科研,快乐生活。
7楼2010-10-20 10:44:51
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baoyan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2010-10-20 10:44:51:

单纯的石墨收敛没有问题,如果石墨烯上再吸附些过渡金属的情况,会有不收敛的现象

你好,你优化单纯的石墨烯都能收敛?碳原子个数不同的模型都能收敛吗?我之前优化(3 3 1)晶胞的纯石墨烯可以收敛,增加碳原子为(4 4 1)的,参数设置都不变,但不能收敛了。
请问你的k网格点选择为多少?我选1*1*10进行积分计算,增加碳原子个数后,我还是用这个值。问下,碳原子个数增多的话,你的k网格点有没有变成其他值?谢谢!
8楼2010-10-21 15:58:50
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.

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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-10-22 08:17:58
引用回帖:
Originally posted by baoyan at 2010-10-21 15:58:50:



你好,你优化单纯的石墨烯都能收敛?碳原子个数不同的模型都能收敛吗?我之前优化(3 3 1)晶胞的纯石墨烯可以收敛,增加碳原子为(4 4 1)的,参数设置都不变,但不能收敛了。
请问你的k网格点选择为多少 ...

个人觉得,这个体系,应该好多文献都做的很详尽了,你看看别人怎么设置的,什么方法,k点的取值一般都有,对一个做的很详尽的体系的重复工作,不应该花太多时间在这上面。不收敛,调调smearing或限制对称性等
祝你好运
快乐科研,快乐生活。
9楼2010-10-21 18:58:58
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wanders

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
学习了,说不定就能用到
10楼2010-10-21 19:06:12
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