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blackwind

铜虫 (小有名气)

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[求助] 根据文献中晶体结构如何重建晶体模型

前两天发过一个这样的帖子，但是有人回应后为了鼓励他，我就把金币给他了，可是问题还是没有解决，但是却没有人回复了，所以再发一个帖子，希望斑竹不要删，如果发现重复，删那个好了。

问：

我因为学习需要，需要将一些文献上的晶体结构资料转换成可以用软件显示的文件，如.cif文档，即使最简单的.xyz文档也可以呀

文献中晶体结构的数据如下

我尝试者转换成cif文档，难度太大，于是凑合着用.xyz文档吧，。xyz文档很简单，比如下例

79
NoName 0.000000
Cu 9.2507 5.8795 -3.6507
O 9.9006 5.0408 -5.1839
O 8.4776 6.7584 -2.1172
N 7.4580 5.2806 -3.8630
N 6.5858 5.6340 -2.8330
N 11.0917 6.2751 -3.0987
N 12.1452 5.6826 -3.6622
H 12.0662 5.1925 -4.2499
C 9.1647 4.4670 -6.1146
C 9.7864 4.1084 -7.3332
H 10.6839 4.3176 -7.4613
C 9.1102 3.4666 -8.3238
H 9.5458 3.2500 -9.1182
C 7.7578 3.1312 -8.1534
。。。。。。。。。
。。。。。。。

可以看出，第一行表示的是原子的个数，第二行不知道，以后都是原子坐标，可以在DS ViewerPro中正常显示，我尝试这把文献数据做成xyz文档，虽然原子都能正常显示，但是却不是个分子，都是一个个孤立的原子点，可能那些键的数据文献上有，我没有输入，但是我就不懂了，为什么那个可以，而我自己的却不可以呢，还是搞不定，希望高手能够帮帮忙，我把那篇文献放在这里，希望能够有人帮忙，非常着急

下载晶体数据文献

，另外能否有好心人帮我看几篇帖子呀，老是说我权限不足。

我自己做的。xyz文件如下
17
NoName 0.000000
N 4667 1462 5436
O 5970 11582 4589
O 6766 12237 3691
O 6171 4548 8573
O 7920 6250 6804
O 4920 3483 9195
O 4347 5085 7548
C 6325 7688 6625
C 6522 5826 7657
C 7056 5320 7748
C 7390 6696 6788
C 7198 8592 5758
C 4712 3486 7958
C 4936 1413 6856
C 6474 11107 4569
C 6668 9072 5679
O 8605 539 5701

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