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根据文献中晶体结构如何重建晶体模型
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前两天发过一个这样的帖子,但是有人回应后为了鼓励他,我就把金币给他了,可是问题还是没有解决,但是却没有人回复了,所以再发一个帖子,希望斑竹不要删,如果发现重复,删那个好了。 问: 我因为学习需要,需要将一些文献上的晶体结构资料转换成可以用软件显示的文件,如.cif文档,即使最简单的.xyz文档也可以呀 文献中晶体结构的数据如下 ![]() ![]() 我尝试者转换成cif文档,难度太大,于是凑合着用.xyz文档吧,。xyz文档很简单,比如下例 79 NoName 0.000000 Cu 9.2507 5.8795 -3.6507 O 9.9006 5.0408 -5.1839 O 8.4776 6.7584 -2.1172 N 7.4580 5.2806 -3.8630 N 6.5858 5.6340 -2.8330 N 11.0917 6.2751 -3.0987 N 12.1452 5.6826 -3.6622 H 12.0662 5.1925 -4.2499 C 9.1647 4.4670 -6.1146 C 9.7864 4.1084 -7.3332 H 10.6839 4.3176 -7.4613 C 9.1102 3.4666 -8.3238 H 9.5458 3.2500 -9.1182 C 7.7578 3.1312 -8.1534 。。。。。。。。。 。。。。。。。 可以看出,第一行表示的是原子的个数,第二行不知道,以后都是原子坐标,可以在DS ViewerPro中正常显示,我尝试这把文献数据做成xyz文档,虽然原子都能正常显示,但是却不是个分子,都是一个个孤立的原子点,可能那些键的数据文献上有,我没有输入,但是我就不懂了,为什么那个可以,而我自己的却不可以呢,还是搞不定,希望高手能够帮帮忙,我把那篇文献放在这里,希望能够有人帮忙,非常着急 ![]() 下载晶体数据文献 ,另外能否有好心人帮我看几篇帖子呀,老是说我权限不足。 我自己做的。xyz文件如下 17 NoName 0.000000 N 4667 1462 5436 O 5970 11582 4589 O 6766 12237 3691 O 6171 4548 8573 O 7920 6250 6804 O 4920 3483 9195 O 4347 5085 7548 C 6325 7688 6625 C 6522 5826 7657 C 7056 5320 7748 C 7390 6696 6788 C 7198 8592 5758 C 4712 3486 7958 C 4936 1413 6856 C 6474 11107 4569 C 6668 9072 5679 O 8605 539 5701 |
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kaixue
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