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gongjijun

木虫 (正式写手)

[交流] 【原创】测试了一下,大概得出castep计算所需内存量与计算体系的关系!与大家共享! 已有27人参与

最近好多新同学发贴求助用castep或者ms计算失败的问题,其中很多和机器内存不足有关,那么多大内存对应计算多大的体系,这个有必要研究研究!
  下午闲来没事,在我的服务器上做了个测试。测试环境如下:
ms4.4,castep,redhat5.0.机器8核,16g内存。
对ZnO分别为32个,64个,128,256个原子的超晶胞进行优化,选fine精度。
参与运算的cpu选了1,2,4,8四种情况进行了测试。对应我们通常所用的单核,双核,四核,八核的机器。
测试结果以.castep中给出的内存使用量为准。结果见图:


其中纵坐标单位为Mb,是所需内存量。横坐标为计算的原子个数。
其中,M1对应单核,M2t对应双核,其他的四核,八核。

结果分析:以下均为不考虑系统所耗内存。
对于32个原子的体系,2G都差不多够了。
64个原子,需要4G,
128个,需要8G
256,需要16G
其中cpu数对内存的影响有但不大。这些都是在不算系统所耗内存的情况下给出的大致范围,考虑到各种参数的影响,这个值也有不同的变化。
测试了能带的计算,和优化差异不大,所以略去。

希望同学在计算的时候能量机使用,多大能耐干多大的活。我曾见到过有人用16核32G的机器castep跑800个原子的,只好一笑而过。
最后说一句,搞这些累死我了。

[ Last edited by gongjijun on 2010-10-12 at 21:41 ]
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css8170

木虫 (正式写手)

楼主辛苦了,很有指导意义。
9楼2010-10-13 00:18:58
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D-frank

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
抱着学习的态度抢沙发,围观楼下
有微博的好友加我哦,搜D-frank就行
2楼2010-10-12 17:49:56
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lzl8181

铁杆木虫 (著名写手)

单身浏览汉


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主真是好人!想请教楼主一个问题:提交并行任务时多核计算应该比较快,对优化来说多核优化时在时间上有没有大的优势?
版权乜有,盗用不究!
3楼2010-10-12 18:51:17
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gongjijun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lzl8181 at 2010-10-12 18:51:17:
楼主真是好人!想请教楼主一个问题:提交并行任务时多核计算应该比较快,对优化来说多核优化时在时间上有没有大的优势?

核多了速度还是会快一点的,当然这里面有效率的问题,核过多的话有个通信的问题。据说是12个核的效率最高。像如果有16核的服务器,究竟是用16核算一个任务好哪,还是分成两个8核的进行两个任务合算哪,这个自己测试一下就知道了。
4楼2010-10-12 19:08:28
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