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niuli金虫 (小有名气)
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【其他】Pwscf不能并行计算
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在服务器上安装pwscf,运行./configure 结束前出现如下信息: ESPRESSO can take advantage of several optimized numerical libraries (essl, fftw, mkl...). This configure script attempts to find them, but may fail if they have been installed in non-standard locations. If a required library is not found, the local copy will be compiled. The following libraries have been found: BLAS_LIBS= -lblas LAPACK_LIBS= -llapack FFT_LIBS=-L/public1/software/fftw/lib -lfftw3 Please check if this is what you expect. If any libraries are missing, you may specify a list of directories to search and retry, as follows: ./configure LIBDIRS="list of directories, separated by spaces" Parallel environment detected successfully.\ Configured for compilation of parallel executables. For more info, read the ESPRESSO User's Guide (Doc/users-guide.tex). -------------------------------------------------------------------- configure: success ./install/configure: line 9250: sort: No such file or directory ./install/configure: line 9247: sed: No such file or directory 我看到并行环境已检测到,且显示成功安装,就没在意后面的两行是什么含义。make all后,尝试运行个例子。 运行命令: /public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 1 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out & (指定用1个处理器计算) /public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 4 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out & (指定用4个处理器计算) 结果发现1个处理器的能进行计算,4个处理器或2个以上都不能运算,结果文件中有如下信息: p0_18612: (1000.488281) Procgroup: p0_18612: (1000.488281) entry 0: node1 0 0 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 1: node 1 1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 2: 4 1 2 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 3: node 1 3 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: p4_error: Could not gethostbyname for host node; may be invalid name : 1001 麻烦大家帮忙指点 |
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2楼2010-10-12 14:32:13
niuli
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