24小时热门版块排行榜    

查看: 1505  |  回复: 4

niuli

金虫 (小有名气)

[交流] 【其他】Pwscf不能并行计算

在服务器上安装pwscf,运行./configure 结束前出现如下信息:


ESPRESSO can take advantage of several optimized numerical libraries
(essl, fftw, mkl...).  This configure script attempts to find them,
but may fail if they have been installed in non-standard locations.
If a required library is not found, the local copy will be compiled.


The following libraries have been found:
  BLAS_LIBS= -lblas
  LAPACK_LIBS= -llapack
  FFT_LIBS=-L/public1/software/fftw/lib -lfftw3
Please check if this is what you expect.

If any libraries are missing, you may specify a list of directories
to search and retry, as follows:
  ./configure LIBDIRS="list of directories, separated by spaces"

Parallel environment detected successfully.\
Configured for compilation of parallel executables.

For more info, read the ESPRESSO User's Guide (Doc/users-guide.tex).
--------------------------------------------------------------------
configure: success
./install/configure: line 9250: sort: No such file or directory
./install/configure: line 9247: sed: No such file or directory

我看到并行环境已检测到,且显示成功安装,就没在意后面的两行是什么含义。make all后,尝试运行个例子。

运行命令:
/public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 1 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x  <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out &
(指定用1个处理器计算)
/public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 4 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x  <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out &
(指定用4个处理器计算)

结果发现1个处理器的能进行计算,4个处理器或2个以上都不能运算,结果文件中有如下信息:

p0_18612: (1000.488281) Procgroup:
p0_18612: (1000.488281)     entry 0: node1 0 0 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli
p0_18612: (1000.488281)     entry 1: node 1 1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli
p0_18612: (1000.488281)     entry 2: 4 1 2 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli
p0_18612: (1000.488281)     entry 3: node 1 3 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli
p0_18612:  p4_error: Could not gethostbyname for host node; may be invalid name
: 1001


麻烦大家帮忙指点
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

子虚乌有5388

木虫 (正式写手)

★ ★
niuli(金币+1):谢谢参与
niuli(金币+1):我试试 2010-10-12 14:35:13
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-10-12 14:36:41
你的是mpich2吧?试一下mpiexec -n 4 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x  <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out &
房无一间,地无一亩,身无分文,胸无大志。
2楼2010-10-12 14:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

niuli

金虫 (小有名气)

还是不能计算

服务器上装的是mpich-1.2.7p1,按照你说的也不能计算
3楼2010-10-12 14:41:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

子虚乌有5388

木虫 (正式写手)


ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-10-12 16:13:10
你是运行例子还是在自己新建的目录下运算,如果是例子是不是并行的环境变量没有设置?你自己建一个目录试试,把例子的结构拷贝进去计算。
按理说有并行环境的话,pwscf默认的应该是并行安装。
房无一间,地无一亩,身无分文,胸无大志。
4楼2010-10-12 15:50:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)


niuli(金币+1):谢谢参与
p0_18612:  p4_error: Could not gethostbyname for host node; may be invalid name

关键是这句话。我觉得可能是不是你的machinefile文件有问题哦
5楼2010-10-12 15:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 niuli 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 268求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-14 6/300 2026-03-14 22:20 by 运气yunqi
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家,不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
信息提示
请填处理意见