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niuli金虫 (小有名气)
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【其他】Pwscf不能并行计算
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在服务器上安装pwscf，运行./configure 结束前出现如下信息： ESPRESSO can take advantage of several optimized numerical libraries (essl, fftw, mkl...). This configure script attempts to find them, but may fail if they have been installed in non-standard locations. If a required library is not found, the local copy will be compiled. The following libraries have been found: BLAS_LIBS= -lblas LAPACK_LIBS= -llapack FFT_LIBS=-L/public1/software/fftw/lib -lfftw3 Please check if this is what you expect. If any libraries are missing, you may specify a list of directories to search and retry, as follows: ./configure LIBDIRS="list of directories, separated by spaces" Parallel environment detected successfully.\ Configured for compilation of parallel executables. For more info, read the ESPRESSO User's Guide (Doc/users-guide.tex). -------------------------------------------------------------------- configure: success ./install/configure: line 9250: sort: No such file or directory ./install/configure: line 9247: sed: No such file or directory 我看到并行环境已检测到，且显示成功安装，就没在意后面的两行是什么含义。make all后，尝试运行个例子。 运行命令： /public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 1 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out & （指定用1个处理器计算） /public1/software/mpich-1.2.7p1-intel/bin/mpirun -np 4 -machinefile ./machinefile1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x <./in2o3.scf.in> in2o3.scf.out & （指定用4个处理器计算） 结果发现1个处理器的能进行计算，4个处理器或2个以上都不能运算，结果文件中有如下信息： p0_18612: (1000.488281) Procgroup: p0_18612: (1000.488281) entry 0: node1 0 0 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 1: node 1 1 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 2: 4 1 2 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: (1000.488281) entry 3: node 1 3 /home/niuli/espresso-4.2/bin/pw.x niuli p0_18612: p4_error: Could not gethostbyname for host node; may be invalid name : 1001 麻烦大家帮忙指点 |
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niuli
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