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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

[交流] 【专家会诊】bay 讨论namd,gmx处理水溶液,蛋白等MD 模拟;讨论水及水通道 已有19人参与

本贴应ghcacj 版主邀请建立
讨论namd/vmd,gmx等软件处理水溶液,蛋白,磷脂等生化体系的模型构建及MD 模拟
讨论水在纳米通道,如AQPs,CNT,PNT,GA等,中结构及传输的理论及模拟研究

本学年面临毕业及升学,可能抽不出很多时间处理论坛的事务
本贴中不及时的回复请见谅

[ Last edited by ghcacj on 2010-10-12 at 10:10 ]



[ Last edited by bay__gulf on 2010-11-25 at 13:01 ]



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jhonsmith001

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):欢迎参与 2010-10-15 14:34:41
问一下专家大哥如何对轨迹文件取平均构象的,我用desmond做的,可以用vmd分析的,该用什么软件做呢 ?谢谢~\(≧▽≦)/~啦啦啦。
3楼2010-10-15 14:18:06
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jhonsmith001

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
谢谢了,我懂了,我看文献不少都是取了一个平均构象的,你的解释是有时候单个构象可能比平均构象会好的,哈,我试试看
5楼2010-10-15 19:54:10
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