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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Turbomole/ORCA » 【求助】Orca 2.8的一个计算赝势的例子报错
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ghcacj

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阿超

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[交流] 【求助】Orca 2.8的一个计算赝势的例子报错 已有1人参与

最新发布的Orca 2.8终于可以计算赝势了，而且手册里也提供了计算赝势的介绍，其中在其第45页上有个简单的例子，输入文件如下：
! BP ECP{def2-TZVP,def2-TZVP/J) def2-tzvp def2-tzvp/j tightscf opt

* xyz -2 2
Au  0    0 0  
Cl  2.5  0 0
Cl -2.5  0 0
Cl  0    2.5 0
Cl  0   -2.5 0
*
但是我却计算不了，运行后再终端和日志文件里显示：
sh: orca: not found

Error encountered when trying to calculate the atomic fitting density! ABORTING THE RUN
我用的系统是Ubuntu 10.04版，之前里面有个叫Orca的东西，是帮助残疾人用电脑的工具，我给它卸载了，但是似乎这个orca程序喜欢调用它，头疼啊。不知道哪位能帮我看看。谢谢！
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1楼 2010-10-11 15:26:46
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天空空

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ghcacj(金币+10):谢谢 2010-10-11 16:33:57
orca没加到环境变量，运行的时候最好(并行计算必须)给出绝对路径.
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好好学习，天天向上！嘿嘿
2楼2010-10-11 16:08:50
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ghcacj

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Originally posted by 天空空 at 2010-10-11 16:08:50:
orca没加到环境变量，运行的时候最好(并行计算必须)给出绝对路径.

我给出绝对路径了，计算一般的计算时都没有问题。但是发现居然是环境变量的问题，以前单核计算的时候，我都是source一下环境变量，然后用链接来算，后来并行时，我发现用绝对路径算，可以不用source一下环境变量，结果今天试了下，居然行了，感谢。

[ Last edited by ghcacj on 2010-10-11 at 16:33 ]
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3楼2010-10-11 16:28:51
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psichologist

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3楼: Originally posted by ghcacj at 2010-10-11 16:28:51:
我给出绝对路径了，计算一般的计算时都没有问题。但是发现居然是环境变量的问题，以前单核计算的时候，我都是source一下环境变量，然后用链接来算，后来并行时，我发现用绝对路径算，可以不用source一下环境变量 ...

你好，我用orca2.8运行ECP例子的时候总是报错Error encountered when trying to calculate the atomic fitting density！
而且所有用ECP的计算都会报错，请问是什么问题？
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4楼2011-10-18 15:46:17
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ghcacj

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4楼: Originally posted by psichologist at 2011-10-18 15:46:17:
你好，我用orca2.8运行ECP例子的时候总是报错Error encountered when trying to calculate the atomic fitting density！
而且所有用ECP的计算都会报错，请问是什么问题？

能否给出具体计算文件，我可以帮你检查一下。
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5楼2011-10-18 16:11:49
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psichologist

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5楼: Originally posted by ghcacj at 2011-10-18 16:11:49:
能否给出具体计算文件，我可以帮你检查一下。

就是手册中给的例子，比如你贴出来的例子
! BP ECP{def2-TZVP,def2-TZVP/J) def2-tzvp def2-tzvp/j tightscf opt

* xyz -2 2
Au  0    0 0  
Cl  2.5  0 0
Cl -2.5  0 0
Cl  0    2.5 0
Cl  0   -2.5 0
*
运行以后就会显示Error encountered when trying to calculate the atomic fitting density!ABORTING THE RUN
只要是用ecp就会出现这个错误

另外，我目前只想做振动光谱，请问什么程序算含有过渡金属的团簇的红外光谱好些，最好是免费的程序，能不能推荐一个或几个？非常感谢！

[ Last edited by psichologist on 2011-10-18 at 18:36 ]
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6楼2011-10-18 18:30:47
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ghcacj

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6楼: Originally posted by psichologist at 2011-10-18 18:30:47:
就是手册中给的例子，比如你贴出来的例子
! BP ECP{def2-TZVP,def2-TZVP/J) def2-tzvp def2-tzvp/j tightscf opt

* xyz -2 2
Au  0    0 0  
Cl  2.5  0 0
Cl -2.5  0 0
Cl  0    2.5 0
Cl  0   - ...

你这个计算是手册中的吧，我记得我以前碰到过的，后来解决了，只是解决方法记不清楚了，好像是要在路径文件里对程序路径设置，调用程序时使用绝对路径调用。

算红外谱图，orca就可以算，至于是否能满足你所说的，我不是专门做这个的，所以也不清楚，你可以问问别人。
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7楼2011-10-18 20:56:20
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psichologist

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7楼: Originally posted by ghcacj at 2011-10-18 20:56:20:
你这个计算是手册中的吧，我记得我以前碰到过的，后来解决了，只是解决方法记不清楚了，好像是要在路径文件里对程序路径设置，调用程序时使用绝对路径调用。

算红外谱图，orca就可以算，至于是否能满足你所说 ...

请问具体怎么设置使用绝对路径调用？我用的是unbuntu。非常感谢！！
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8楼2011-10-18 21:47:19
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ghcacj

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8楼: Originally posted by psichologist at 2011-10-18 21:47:19:
请问具体怎么设置使用绝对路径调用？我用的是unbuntu。非常感谢！！

绝对路径就是将orca的可执行文件所在的绝对路径写出来，比如：
>> /home/XXX/orca/orca  test.in > out.log
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9楼2011-10-18 22:38:26
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psichologist

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9楼: Originally posted by ghcacj at 2011-10-18 22:38:26:
绝对路径就是将orca的可执行文件所在的绝对路径写出来，比如：
>> /home/XXX/orca/orca  test.in > out.log

用绝对路径还是出现同样的错误。。。。
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10楼2011-10-19 00:22:46
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