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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】atk中自定义电极

如题 想问一下 atk中怎么样修改电极 将电极修改成不一样的,脚本中
electrode_repetitions=[[3,3],[3,3]],代表的是电极的层数也就是常说的3*3电极
equivalent_atoms=([0,0],[-1,-1])指的是周期性电极中相等的原子,这两个我知道
我想问的是
electrode_elements = [Gold, Gold, Gold]
electrode_coordinates = [[  0.00000000e+00,   0.00000000e+00, 0.00000000e+00],
[  1.11022302e-16,   1.66483653e+00,   2.35443440e+00],
[  1.44179073e+00,   8.32418264e-01,   4.70886880e+00]]*Angstrom

electrode_cell = [[ 2.88358145,  0.        ,  0.        ],
                  [-1.44179073,  2.49725479,  0.        ],
                  [ 0.        ,  0.        ,  7.06330319]]*Angstrom
这两个是什么意思? 分别表示的设置的什么?
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)


有知道怎么弄的吗? 跪求呀
2楼2010-09-26 16:24:15
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ifmc1234

木虫 (著名写手)


kaypu(金币+3):晶格常数矢量这个我知道了,非常感谢, 2010-09-26 20:56:06
163.com(金币+1):不宁赐教 2010-09-26 22:27:17
引用回帖:
Originally posted by kaypu at 2010-09-25 21:22:40:
如题 想问一下 atk中怎么样修改电极 将电极修改成不一样的,脚本中
electrode_repetitions=[[3,3],[3,3]],代表的是电极的层数也就是常说的3*3电极
equivalent_atoms=([0,0],[-1,-1])指的是周期性电极中相等的原 ...

electrode_elements = [Gold, Gold, Gold]
electrode_coordinates = [[  0.00000000e+00,   0.00000000e+00, 0.00000000e+00],
[  1.11022302e-16,   1.66483653e+00,   2.35443440e+00],
[  1.44179073e+00,   8.32418264e-01,   4.70886880e+00]]*Angstrom

上面两个表示Au元素和其坐标。它与下面的晶格常数进行联系。也就是你上面说的要进行扩展3X3,也即每层9个Au。

electrode_cell = [[ 2.88358145,  0.        ,  0.        ],
                  [-1.44179073,  2.49725479,  0.        ],
                  [ 0.        ,  0.        ,  7.06330319]]*Angstrom

这是晶格常数矢量。
3楼2010-09-26 20:06:16
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2010-09-26 20:06:16:


electrode_elements = [Gold, Gold, Gold]
electrode_coordinates = [[  0.00000000e+00,   0.00000000e+00, 0.00000000e+00],
[  1.11022302e-16,   1.66483653e+00,   2.35443440e+00],
[  1.44179073e+ ...

你说的这个electrode_elements = [Gold, Gold, Gold]是怎么和晶格常数矢量联系在一起的?
4楼2010-09-26 21:08:14
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