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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】DMOL3搜索过渡态计算失败——关于虚频
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duantian0529

金虫 (小有名气)
★
lovemydog(金币+1): 谢谢参与
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7楼: Originally posted by lovemydog at 2010-09-29 10:24:36
非常感谢你的回答。
我在计算的frequency是用dmol3进行几何优化时性质栏勾选上的，而vibrational analysis就是对这个frequency分析。
按你说的，对应虚频的振动方向来调整分子结构有什么原则或规律指导么？或者 ...

确实觉着没有准则，请问你现在知道什么准则了吗？望分享~
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加油哦！
11楼2015-03-06 14:32:53
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duantian0529

金虫 (小有名气)
其实一般不做优化，直接拿search后的文件进行第三步，进行过渡态确认。
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加油哦！
12楼2015-03-06 14:36:02
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★
lovemydog(金币+1): 谢谢参与
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12楼: Originally posted by duantian0529 at 2015-03-06 14:36:02
其实一般不做优化，直接拿search后的文件进行第三步，进行过渡态确认。

过渡态的确定只能确定路径是否是基元反应。如果你确定你的反应历程确实是这样，非常有把握当中不会再有中间体，那么与您的想法相反，直接做过渡态优化即可，可以省去确定的步骤。

但做之前需要进行频率计算，然后可根据在tools的reaction的工具中查看振动模，选取与反应相关的虚频振动模并进行过渡态优化即可。

对于周期体系，可能会出现1~3个低模、低频的虚频，不过没啥意义，就算不消除也没多大影响，只要存在那个正常的沿着反应方向的虚频即可。

如果上述方法对于某虚频还是无法消除，那么把非反应方向的虚频的键长拉伸1.3~1.5倍，再进行过渡态优化，最好注意一下力的收敛。

过渡态优化之后建议再重新计算频率来考察虚频是否满足过渡态。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
13楼2015-03-06 23:34:36
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duantian0529

金虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-03-06 23:34:36
过渡态的确定只能确定路径是否是基元反应。如果你确定你的反应历程确实是这样，非常有把握当中不会再有中间体，那么与您的想法相反，直接做过渡态优化即可，可以省去确定的步骤。

但做之前需要进行频率计算，然 ...

非常感谢！你说过渡态优化主要优化的是啥呢？
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加油哦！
14楼2015-03-07 11:35:08
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
14楼: Originally posted by duantian0529 at 2015-03-07 11:35:08
非常感谢！你说过渡态优化主要优化的是啥呢？...

消除不合理的虚频。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
15楼2015-03-07 12:08:12
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18796262890

新虫 (小有名气)
★
lovemydog(金币+1): 谢谢参与
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8楼: Originally posted by homebaby at 2010-09-29 15:53:49
我也在用dmol做过渡态,参照的是创腾公司的教程，1确定.产物反应物没有虚频2.过渡态搜索同时勾选Frequency3.分析过渡态的frequency，若不是只有一个虚频，就需要做TS Optimization 3.过渡态验证：TS confirmation. 我 ...

怎么判断过渡态结果的正确？
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16楼2017-09-19 10:27:22
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18796262890

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by jinna319 at 2014-10-22 11:26:57
你好！你说的第三步过渡态验证，使用的文件是search后的那个xtd文件，还是优化后的xtd文件？...

用的那个文件啊？
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17楼2017-09-19 10:27:54
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18796262890

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by jinna319 at 2014-10-22 11:26:57
你好！你说的第三步过渡态验证，使用的文件是search后的那个xtd文件，还是优化后的xtd文件？...

请问楼主用哪个呢
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18楼2017-09-21 19:41:01
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
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18楼: Originally posted by 18796262890 at 2017-09-21 19:41:01
请问楼主用哪个呢...

用search的。
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19楼2017-09-24 08:13:16
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白小花余

新虫 (初入文坛)
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lovemydog(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
7楼: Originally posted by lovemydog at 2010-09-29 10:24:36
非常感谢你的回答。
我在计算的frequency是用dmol3进行几何优化时性质栏勾选上的，而vibrational analysis就是对这个frequency分析。
按你说的，对应虚频的振动方向来调整分子结构有什么原则或规律指导么？或者 ...

您好 请问多个虚频这个问题您解决了没
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20楼2018-12-01 16:36:43
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