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lovemydog银虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】DMOL3搜索过渡态计算失败——关于虚频
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前两天使用DMOL3做了一个过渡态搜索，在对生成的过渡态进行frequency计算（vibration analysis）后，发现有很多虚频，请问下大家该怎么样消掉虚频呢?有没有一些具体的方法或者参考资料都行。另外在计算的时候如果发现在进行vibration analysis后没有虚频该怎么办？ 希望大家能给点意见和指导，先谢谢大家了  [ Last edited by lovemydog on 2010-9-24 at 21:14 ] |
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lovemydog(金币+1): 谢谢参与
lovemydog(金币+1): 谢谢参与
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过渡态的确定只能确定路径是否是基元反应。如果你确定你的反应历程确实是这样，非常有把握当中不会再有中间体，那么与您的想法相反，直接做过渡态优化即可，可以省去确定的步骤。 但做之前需要进行频率计算，然后可根据在tools的reaction的工具中查看振动模，选取与反应相关的虚频振动模并进行过渡态优化即可。 对于周期体系，可能会出现1~3个低模、低频的虚频，不过没啥意义，就算不消除也没多大影响，只要存在那个正常的沿着反应方向的虚频即可。 如果上述方法对于某虚频还是无法消除，那么把非反应方向的虚频的键长拉伸1.3~1.5倍，再进行过渡态优化，最好注意一下力的收敛。 过渡态优化之后建议再重新计算频率来考察虚频是否满足过渡态。 |
13楼2015-03-06 23:34:36
qiangwxr
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lovemydog(金币+1):谢谢参与
lovemydog(金币+1): 2010-09-29 10:16:51
aylayl08(金币+2):谢谢解释 2010-09-29 12:21:46
lovemydog(金币+1):谢谢参与
lovemydog(金币+1): 2010-09-29 10:16:51
aylayl08(金币+2):谢谢解释 2010-09-29 12:21:46
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1. “在对生成的过渡态进行frequency计算（vibration analysis）后”，你具体是怎么进行frequency计算？是DMol3 Energy计算时选上frequency吗？还是直接用菜单Tool-vibration analysis？ 2. 如果没有用DMol3等模块计算过频率，直接分析的话似乎强度都是零。 3. 出现虚频，好像是观看虚频对应的振动方向，然后调整分子结构。 |
4楼2010-09-29 08:20:31
lovemydog
银虫 (小有名气)
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7楼2010-09-29 10:24:36
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8楼2010-09-29 15:53:49
200