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gtolv8688

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何在MS中优化由CCDC导出的cif文件? 已有7人参与

我在CCDC中查询了MOF-1的结构并将其导出,导出的文件格式是cif,用MS打开后发现结构非常乱,化学式与文献上的不同,多出了一些C原子,没有成键,没有加氢,请问给为高人你们遇到这种情况是如何处理的?为什么CCDC中给出的结构这么乱而且与文献不一致呢?要怎么处理呢?
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
在CCDC里面的cif结构文件是XRD方法确定出来的机构,其对称性、原子占位并非完全准确,
到了MS后,根据对称性就会反演出很多个原本并不存在的原子。
比如原子位置应该在(0.33333,0.666667,0) ,而在在cif结构文件里面可能是(0.332,0.666,0),就这点的误差就足够导致对称性的不一致。
储氢家族欢迎储氢研究者!
4楼2010-09-24 13:01:44
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