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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 粉末晶体 » 【求助】为什么用TOPAS做indexing搜索每次给出的solution都不一样??
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受

[交流] 【求助】为什么用TOPAS做indexing搜索每次给出的solution都不一样??已有3人参与

只选了monoclinic-C 这一个晶系,搜索出来可能的晶胞,GOF vs. Volume 图每次都不一样啊~~~

什么都没改...

求教~~
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超越性别的爱情才是纯粹的爱情
1楼2010-09-21 19:13:45
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受
我顶~~~
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超越性别的爱情才是纯粹的爱情
2楼2010-09-23 09:41:55
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hanhaixf-77

铁杆木虫 (著名写手)
★
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wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-10-04 08:56:01
你这种求助，神仙也帮不了！
没有具体数据和软件使用过程，什么原因都有可能！对不？
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3楼2010-10-01 13:53:36
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受
引用回帖:
Originally posted by hanhaixf-77 at 2010-10-01 13:53:36:
你这种求助，神仙也帮不了！
没有具体数据和软件使用过程，什么原因都有可能！对不？

sure, 我想问的意思是TOPAS 在做LSI indexing的结果不稳定. 是什么原因造成的?

现贴出如下CuKα 1.540596扫描的数据,请各位大侠只shearch Trigonal-Hexagonal-P 和Monoclinic-C两个晶系的空间群就好了, 请各位试一下, search 的结果是否稳定.

谢谢~



        Use        Th2        Use        Weighting        Good
1        1        6.653204        1        79.59666        0
2        1        11.07651        1        0.9307586        0
3        1        17.33991        1        11.4315        0
4        1        19.36686        1        41.35222        0
5        1        23.01738        1        40.10552        0
6        1        28.29693        1        181.3957        0
7        1        35.05775        1        137.5761        0
8        1        40.95601        1        6.360925        0
9        1        53.05346        1        219.5537        0
10        1        61.22772        1        96.26475        0
11        1        72.26469        1        3.996228        0
12        1        75.55106        1        75.83732        0
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超越性别的爱情才是纯粹的爱情
4楼2010-10-01 19:42:35
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hanhaixf-77

铁杆木虫 (著名写手)
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wsht212(金币+2):谢谢交流，希望常来！ 2010-10-04 08:56:27
结果不稳定表示收敛不好，从你的数据看，
（1）衍射线少，尤其是低角度数据，
（2）LSI指标化存在局限性，这点建议参考技术手册和相关文献
（3）另外，为什么仅仅局限在特定的晶系搜索？
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5楼2010-10-03 22:19:11
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受
引用回帖:
Originally posted by hanhaixf-77 at 2010-10-03 22:19:11:
结果不稳定表示收敛不好，从你的数据看，
（1）衍射线少，尤其是低角度数据，
（2）LSI指标化存在局限性，这点建议参考技术手册和相关文献
（3）另外，为什么仅仅局限在特定的晶系搜索？

谢谢这位老师~~
这个样品是clay mineral, 2:1的smectite 家族~~
可能是nontronite~~

（1）衍射线少，尤其是低角度数据，
-------------么法啊~~clay mineral 扫出来全是馒头峰....还有非对称峰...用SPV line fit出来的这10几条reflection~~
（2）LSI指标化存在局限性，这点建议参考技术手册和相关文献
--------------我也尝试过LP search了~~~一次只能搜索一个晶系,开了continue after convergence,再LP.LOG找Rwp最小的~~~但是这个感觉跟直接用hkl_Is phase做WPPD没区别....
（3）另外，为什么仅仅局限在特定的晶系搜索？
所有在PDF4 2009的nontronite只有这两个晶系的卡片....
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超越性别的爱情才是纯粹的爱情
6楼2010-10-03 22:44:47
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hanhaixf-77

铁杆木虫 (著名写手)
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wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-10-05 20:13:20
引用回帖:
Originally posted by iangie at 2010-10-03 22:44:47:


谢谢这位老师~~
这个样品是clay mineral, 2:1的smectite 家族~~
可能是nontronite~~

（1）衍射线少，尤其是低角度数据，
-------------么法啊~~clay mineral 扫出来全是馒头峰....还有非对称峰...用SPV ...

按照你介绍的详细样品情况，这是不能直接指标化的样品，建议你用Topas进行物相拟合精修，将无定形相和结晶相分离，同时获得新的晶胞参数——这也是指标化想得到的结果。——当然，前提是样品真的就是你所提的矿物或者同构体。
顺便问一下，你现在用的Topas是最新版的4.2？
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7楼2010-10-05 19:19:05
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受
引用回帖:
Originally posted by hanhaixf-77 at 2010-10-05 19:19:05:
建议你用Topas进行物相拟合精修，将无定形相和结晶相分离，同时获得新的晶胞参数——这也是指标化想得到的结果

我这个矿物是hydrated nontronite
"TOPAS物相拟合精修,将无定形相和结晶相分离"
请问这一步是怎么做呢?是用structure 来refine吗?
但是ICSD AMCSD中都没有水合态nontronite的cif结构啊~

贴个raw pattern,无定形相不明显


嗯~~是TOPAS 4.2~~~据说TOPAS 5快发布了~~~
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超越性别的爱情才是纯粹的爱情
8楼2010-10-06 10:22:01
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xujun16

银虫 (著名写手)
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wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-10-06 15:52:51

这样的数据，是不能做指标化的！
因为最关键的因素是连准确的峰也找不到。
谢谢参考！
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9楼2010-10-06 15:07:17
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iangie

木虫 (著名写手)

强气受
引用回帖:
Originally posted by xujun16 at 2010-10-06 15:07:17:

这样的数据，是不能做指标化的！
因为最关键的因素是连准确的峰也找不到。
谢谢参考！

有种PONKCS method可以build hkl_Is phase, 我就在做这个事情....可以尽量指标化到某个参照的PDF卡片上....

不过确实像5楼的老师说的那样indexing结果不一致表示收敛性不好~~~

[ Last edited by iangie on 2010-10-11 at 18:39 ]
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10楼2010-10-11 18:38:39
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