24小时热门版块排行榜    

查看: 2044  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

362720651

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】更改源代码 并行出问题 已有6人参与

我最近对lammps中 deposit的源代码进行了更改,然后编译运行在我的单核上都没问题,但在集群服务器上,就不能输出dump,运行会自动终止,也不报错,log文件变空白。但在单机运行是没问题的,自己解决了好久也不知道问题出在哪里,不知道有没有前辈有类似的经验。
我在deposit源文件中增加的代码如下:
int i,j;
>  int flag,flagall;
>  double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq;
>  double *newcoord;
>  double **x = atom->x;
>  int    *mask = atom->mask;
>  int    nlocal = atom->nlocal;
>  int    natoms;
>  int    data = 0;
>  Region *region = domain->regions[iregion];
>
>  for(int i=0; i< nlocal ; i++) {
>    if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2]))  data += 1;
>  }
>  MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world);
感觉就算其中涉及到并行问题的代码,也就是最后一句,都是模仿lammps源代码编写的,不知道问题出在哪里。
希望前辈能给予指点,万分感谢 谢谢了!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
如果说用原位调试的话,加编译调试代码选项后编译,再用totalview进行调试。不知道你能不能玩得转?
7楼2010-09-20 21:44:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

zyj8119

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帮顶,呼唤老虎大王,哈哈,你是这方面的专家。
好好学习,天天向上。
2楼2010-09-14 14:57:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

362720651

新虫 (初入文坛)

再说一下 运行别的例子都没问题的
一旦用到我改了代码的deposit命令  就不dump
别的列子可以运行  说明集群服务器的mpi通信配置没问题的
但为什么单机单核可以计算 集群并行就不行了呢?
3楼2010-09-14 15:00:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

362720651

新虫 (初入文坛)

有前辈指导么。。555
4楼2010-09-15 15:19:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +7 步川酷紫123 2026-03-13 7/350 2026-03-18 17:12 by 尽舜尧1
[考研] 化学工程321分求调剂 +15 大米饭! 2026-03-15 18/900 2026-03-18 14:52 by haxia
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +6 Losir 2026-03-12 7/350 2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
信息提示
请填处理意见