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【求助】更改源代码 并行出问题 已有6人参与
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我最近对lammps中 deposit的源代码进行了更改，然后编译运行在我的单核上都没问题，但在集群服务器上，就不能输出dump，运行会自动终止，也不报错，log文件变空白。但在单机运行是没问题的，自己解决了好久也不知道问题出在哪里，不知道有没有前辈有类似的经验。 我在deposit源文件中增加的代码如下： int i,j; > int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 感觉就算其中涉及到并行问题的代码，也就是最后一句，都是模仿lammps源代码编写的，不知道问题出在哪里。 希望前辈能给予指点，万分感谢 谢谢了！！ |
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3楼2010-09-14 15:00:31
2楼2010-09-14 14:57:13
4楼2010-09-15 15:19:16
bluewhale
铁杆木虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):谢谢指教 2010-09-15 22:55:55
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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> int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 首先定位错误，将最后一行comment掉，编译后运行。如果没有问题，说明是最后一行的问题，检查world传入的是否有问题。 |
5楼2010-09-15 20:43:44
